118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4586 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
604 aa  1175    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  66.24 
 
 
557 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  42.86 
 
 
556 aa  280  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  50.17 
 
 
558 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  37.61 
 
 
661 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  39.34 
 
 
397 aa  170  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  37.99 
 
 
663 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  37.66 
 
 
663 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  35.64 
 
 
614 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  33.1 
 
 
616 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  34.47 
 
 
679 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  39.33 
 
 
410 aa  150  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  31.34 
 
 
666 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  40.3 
 
 
410 aa  147  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  37.59 
 
 
413 aa  143  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  32.97 
 
 
415 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  33.83 
 
 
403 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  32.09 
 
 
414 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  32.84 
 
 
414 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 
411 aa  124  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  32.26 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  32.55 
 
 
459 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  27.52 
 
 
785 aa  73.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  27.78 
 
 
682 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  27.33 
 
 
786 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.76 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.76 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  25.93 
 
 
705 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  24.52 
 
 
521 aa  70.5  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  22.46 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  24.13 
 
 
705 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  27.47 
 
 
817 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  25.27 
 
 
967 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  27.47 
 
 
817 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  25.27 
 
 
967 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.27 
 
 
378 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  26.37 
 
 
723 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  25.63 
 
 
667 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  25.63 
 
 
670 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  30.27 
 
 
708 aa  64.7  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  25.51 
 
 
429 aa  63.9  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  26.98 
 
 
663 aa  63.9  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.67 
 
 
384 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 
840 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  24.92 
 
 
706 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  30.77 
 
 
395 aa  61.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  30.26 
 
 
660 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  27.02 
 
 
413 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  24.3 
 
 
648 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  25.21 
 
 
634 aa  60.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0171  putative PAS/PAC sensor protein  23.79 
 
 
385 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  25.81 
 
 
410 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  25.77 
 
 
786 aa  59.7  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  22.66 
 
 
362 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  25.66 
 
 
409 aa  58.2  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1539  protein serine/threonine phosphatase  25.29 
 
 
363 aa  57.4  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  28.95 
 
 
637 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  23.44 
 
 
705 aa  56.6  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  26.53 
 
 
378 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  27.11 
 
 
251 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  26.97 
 
 
559 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.19 
 
 
590 aa  54.7  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  24.74 
 
 
396 aa  54.7  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  26.19 
 
 
633 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.3 
 
 
516 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  25.37 
 
 
397 aa  53.9  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  25.08 
 
 
393 aa  53.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  24.07 
 
 
642 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  24.36 
 
 
885 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  32.26 
 
 
715 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  26.59 
 
 
404 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  26.26 
 
 
1082 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  25.39 
 
 
643 aa  52.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  23.62 
 
 
754 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  26.32 
 
 
360 aa  51.2  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4365  response regulator receiver protein  29.17 
 
 
340 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1749  putative PAS/PAC sensor protein  22.92 
 
 
377 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  28.36 
 
 
1100 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.25 
 
 
572 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  25.5 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  28.51 
 
 
828 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29 
 
 
523 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  35.07 
 
 
765 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1479  response regulator receiver protein  30.37 
 
 
402 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  24.52 
 
 
645 aa  47.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  23.28 
 
 
708 aa  48.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0999  response regulator receiver protein  32.29 
 
 
452 aa  48.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.766542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  30.23 
 
 
400 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  27.3 
 
 
846 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  23.67 
 
 
642 aa  47.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  26.52 
 
 
644 aa  47.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  21.23 
 
 
543 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  33.61 
 
 
423 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  24.16 
 
 
657 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  26.47 
 
 
434 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.91 
 
 
1480 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  27.64 
 
 
418 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.62 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  26.81 
 
 
851 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>