207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1013 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  100 
 
 		 556 aa  1117    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  52.51 
 
 		 558 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  42.02 
 
 		 557 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  43.55 
 
 		 604 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  31.8 
 
 		 521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  34.28 
 
 		 661 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  31.07 
 
 		 679 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  34.8 
 
 		 616 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  36.19 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  31 
 
 		 666 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  35.23 
 
 		 614 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  34.62 
 
 		 414 aa  163  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  34.45 
 
 		 663 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  33.46 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  34.11 
 
 		 663 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  34.07 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  34.44 
 
 		 415 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  33.72 
 
 		 411 aa  153  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  35.91 
 
 		 413 aa  144  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 		 410 aa  143  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  33.72 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  33.96 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  27.21 
 
 		 785 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  28.52 
 
 		 459 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  29.82 
 
 		 786 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  29.82 
 
 		 779 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.19 
 
 		 692 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  26.32 
 
 		 785 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2224  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.05 
 
 		 820 aa  93.6  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.387705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.7 
 
 		 782 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 787 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.54 
 
 		 871 aa  92  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  24.83 
 
 		 796 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4365  GGDEF domain/EAL domain protein  25.49 
 
 		 683 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  26.6 
 
 		 778 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4060  GGDEF  25.52 
 
 		 705 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  26.3 
 
 		 785 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  26.3 
 
 		 785 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0980  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.69 
 
 		 683 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  25.32 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  24 
 
 		 783 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0914  GGDEF domain-containing protein  23.29 
 
 		 693 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4487  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.08 
 
 		 683 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.29 
 
 		 694 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4938  putative lipoprotein  24.79 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4474  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.29 
 
 		 683 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.88 
 
 		 711 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.444283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56790  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  23.93 
 
 		 687 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0171  putative PAS/PAC sensor protein  24.61 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  26.33 
 
 		 772 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  24.33 
 
 		 404 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3385  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.21 
 
 		 677 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.093446  hitchhiker  0.00322897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3056  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.36 
 
 		 679 aa  72  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.029022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2823  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.41 
 
 		 677 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.992425  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3557  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.4 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.026762  decreased coverage  0.00000188852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3308  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.44 
 
 		 806 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  29.1 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37830  GGDEF domain-containing protein  25.79 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.42033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  23.95 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0965  GGDEF domain-containing protein  24.26 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00724002  normal  0.0458332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  27.84 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1749  putative PAS/PAC sensor protein  24.92 
 
 		 377 aa  67  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4359  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.74 
 
 		 804 aa  67  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161246  hitchhiker  0.00406944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  26.47 
 
 		 786 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  26.54 
 
 		 1087 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  26.92 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  21.22 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4119  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.2 
 
 		 543 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.158695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  25.38 
 
 		 785 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  26.6 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  24.81 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1539  protein serine/threonine phosphatase  30.41 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.91 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  24.21 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  26.02 
 
 		 786 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  21.92 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  25.68 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  25.93 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.22 
 
 		 384 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  23.47 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.22 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  26.11 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  25.67 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  25.38 
 
 		 1087 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  23.4 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  21.78 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  24.54 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  20.81 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  25.11 
 
 		 683 aa  58.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3700  serine phosphatase  21.66 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  21.8 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  26.29 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  26.48 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.26 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  28.64 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  26.06 
 
 		 705 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 394 aa  57  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  25.77 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  23.26 
 
 		 708 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.36 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>