259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1473 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 558 aa  1095    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  51.63 
 
 		 556 aa  475  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  48.82 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  50.17 
 
 		 604 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  32.08 
 
 		 679 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  39.1 
 
 		 661 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  32.53 
 
 		 616 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 		 614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  29.66 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  32.65 
 
 		 666 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  33.85 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  34.52 
 
 		 663 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  34.19 
 
 		 663 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  34.81 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  33.71 
 
 		 414 aa  148  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  33.96 
 
 		 403 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  35.21 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  36.57 
 
 		 411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  36.43 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  34.98 
 
 		 410 aa  134  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 410 aa  126  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  29.68 
 
 		 459 aa  110  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  31.06 
 
 		 786 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  31.14 
 
 		 779 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.26 
 
 		 796 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.35 
 
 		 782 aa  90.5  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  28.37 
 
 		 778 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  24.81 
 
 		 543 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  26.07 
 
 		 783 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  25.18 
 
 		 785 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 787 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  24.64 
 
 		 785 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  28.72 
 
 		 772 aa  80.1  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2224  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.22 
 
 		 820 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.387705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2823  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.9 
 
 		 677 aa  77  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.992425  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  27.8 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  30.23 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  25.1 
 
 		 785 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3557  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.1 
 
 		 677 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.026762  decreased coverage  0.00000188852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1539  protein serine/threonine phosphatase  26.1 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  24.55 
 
 		 683 aa  74.7  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  29.14 
 
 		 715 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  25.1 
 
 		 785 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  26.78 
 
 		 663 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.48 
 
 		 590 aa  72.8  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  28.07 
 
 		 840 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  28.67 
 
 		 633 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3385  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.68 
 
 		 677 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.093446  hitchhiker  0.00322897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0965  GGDEF domain-containing protein  25.21 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00724002  normal  0.0458332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4487  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.46 
 
 		 683 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0980  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.61 
 
 		 683 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.34 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  23.9 
 
 		 559 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4060  GGDEF  24.18 
 
 		 705 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  28.84 
 
 		 395 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.9 
 
 		 694 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  27.87 
 
 		 451 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0914  GGDEF domain-containing protein  24.7 
 
 		 693 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  22.13 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  25.77 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  28.24 
 
 		 786 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  25.58 
 
 		 667 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  25.58 
 
 		 670 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.45 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  30.45 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  30.45 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  29.23 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  29.23 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  24.11 
 
 		 785 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  29.23 
 
 		 630 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4474  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.5 
 
 		 683 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4365  GGDEF domain/EAL domain protein  23.36 
 
 		 683 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  27.73 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  27.31 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  30.13 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.69 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  28.21 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  25.18 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1018  GGDEF domain-containing protein  28.4 
 
 		 678 aa  65.1  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4359  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.11 
 
 		 804 aa  65.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161246  hitchhiker  0.00406944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3308  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.8 
 
 		 806 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  26.77 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.46 
 
 		 692 aa  64.3  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  25.46 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.28 
 
 		 957 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.52 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  27.12 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  27.88 
 
 		 637 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.32 
 
 		 507 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  25.45 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.69 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.83 
 
 		 711 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.444283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0994  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.21 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.031573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  29.18 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.04 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  27.56 
 
 		 723 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  22.63 
 
 		 378 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  25.38 
 
 		 716 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>