103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1587 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 459 aa  918    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  41.83 
 
 		 410 aa  313  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  41.53 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  39.34 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  42.17 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  41.83 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  40.05 
 
 		 411 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  36.76 
 
 		 414 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  36.99 
 
 		 414 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  39.04 
 
 		 410 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  36.91 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  31.58 
 
 		 616 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  30.85 
 
 		 614 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  32.51 
 
 		 663 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  32.16 
 
 		 663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  31.53 
 
 		 661 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  29.76 
 
 		 679 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.9 
 
 		 616 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0426  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.9 
 
 		 616 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.1 
 
 		 613 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.435912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.09 
 
 		 612 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2357  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.5 
 
 		 613 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2971  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.5 
 
 		 613 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2966  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.42 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2991  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.92 
 
 		 615 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.92 
 
 		 612 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140333  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3536  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.54 
 
 		 587 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2881  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.92 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.54 
 
 		 610 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.49 
 
 		 611 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  30.1 
 
 		 666 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.8 
 
 		 627 aa  103  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.590205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  32.48 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.31 
 
 		 637 aa  99.8  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3107  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.4 
 
 		 610 aa  99.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2453  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.4 
 
 		 633 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.81 
 
 		 594 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.81 
 
 		 594 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.07 
 
 		 598 aa  97.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.56 
 
 		 676 aa  97.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  29.33 
 
 		 558 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  27.92 
 
 		 556 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  31.21 
 
 		 604 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.34 
 
 		 606 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0461  CBS/GGDEF/EAL domain-containing protein  35.56 
 
 		 594 aa  81.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  32.81 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2422  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28 
 
 		 617 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.411965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.68 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  24.8 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3632  histidine kinase  30.06 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0739  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.83 
 
 		 735 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  28.57 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.11 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  25.21 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1044  histidine kinase  32.61 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.949503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.06 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.73 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.58 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.33 
 
 		 710 aa  58.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.405196  hitchhiker  0.000791154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  30 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2369  diguanylate cyclase  25 
 
 		 353 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34805  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  22.37 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0983  histidine kinase  32.11 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.5 
 
 		 583 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  23.03 
 
 		 584 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  24.06 
 
 		 584 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  25.09 
 
 		 775 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.06 
 
 		 584 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  27.63 
 
 		 582 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.06 
 
 		 583 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.75 
 
 		 599 aa  53.5  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.08 
 
 		 766 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.32 
 
 		 605 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.56 
 
 		 590 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  21.14 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.31 
 
 		 585 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  22.07 
 
 		 840 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.31 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.96 
 
 		 584 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.31 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.31 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.34 
 
 		 786 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  27.06 
 
 		 592 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  25.49 
 
 		 601 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22 
 
 		 590 aa  50.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 584 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  23.72 
 
 		 660 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  23.48 
 
 		 705 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  27.41 
 
 		 590 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.73 
 
 		 797 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5974  putative diguanylate phosphodiesterase  29.32 
 
 		 349 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.35402  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.22 
 
 		 773 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  22.7 
 
 		 468 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  22.39 
 
 		 648 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  25.2 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.6 
 
 		 883 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  28.7 
 
 		 590 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  23.26 
 
 		 705 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  22.31 
 
 		 708 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  22.15 
 
 		 644 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>