More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3753 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 
393 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 
393 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  76.19 
 
 
378 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  64.96 
 
 
967 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  64.96 
 
 
967 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  55.13 
 
 
682 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  61.02 
 
 
670 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  61.02 
 
 
667 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  63.39 
 
 
705 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  62.93 
 
 
840 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  57.25 
 
 
817 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  57.25 
 
 
817 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  63.79 
 
 
251 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  51.87 
 
 
521 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  49.81 
 
 
663 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  53.33 
 
 
786 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  42.06 
 
 
785 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  41.74 
 
 
786 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  37.78 
 
 
389 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  56.05 
 
 
359 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3967  putative response regulator of a two-component system  57.32 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000645274  normal  0.0110626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  55.13 
 
 
362 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4124  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  61.48 
 
 
334 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113929  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1099  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  61.48 
 
 
334 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16500  two-component response regulator  57.53 
 
 
347 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1494  response regulator/GGDEF domain-containing protein  60.74 
 
 
335 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.799611 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5389  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  55 
 
 
372 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  60.74 
 
 
334 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1499  response regulator/GGDEF domain protein  62.22 
 
 
334 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1309  GGDEF  62.22 
 
 
334 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1436  two-component response regulator  58.87 
 
 
327 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1058  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  60.74 
 
 
333 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0856452  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  61.94 
 
 
364 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3470  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  53.21 
 
 
353 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843913  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  61.94 
 
 
365 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  61.94 
 
 
364 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  61.94 
 
 
364 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  61.94 
 
 
365 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  61.94 
 
 
365 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  61.94 
 
 
365 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  61.94 
 
 
364 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3449  diguanylate cyclase  53.21 
 
 
357 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4311  diguanylate cyclase  52.56 
 
 
354 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4055  diguanylate cyclase  52.56 
 
 
354 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33875  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  51.88 
 
 
345 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3956  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  52.56 
 
 
357 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.892783  normal  0.485051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2018  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  51.92 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.04 
 
 
377 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.04 
 
 
363 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.04 
 
 
377 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.04 
 
 
377 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.04 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.45 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.04 
 
 
363 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0420  response regulator receiver protein  52.94 
 
 
172 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.370245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  33.59 
 
 
630 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
630 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
630 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.21 
 
 
384 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  33.74 
 
 
366 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.68 
 
 
1332 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.79 
 
 
642 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  34.22 
 
 
633 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.36 
 
 
642 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  32.44 
 
 
543 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  32.02 
 
 
1087 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  29.76 
 
 
1100 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.41 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.83 
 
 
1087 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.73 
 
 
526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  30.26 
 
 
684 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.31 
 
 
388 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  30.71 
 
 
1079 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 
649 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.45 
 
 
631 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  26.18 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.96 
 
 
649 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  30.11 
 
 
775 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.22 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.74 
 
 
637 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  26.57 
 
 
754 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  25.44 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.83 
 
 
572 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  28.23 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.57 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0020  stage II sporulation E family protein  27.65 
 
 
464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329951  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.35 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  28.21 
 
 
377 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 
536 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  29.04 
 
 
846 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.69 
 
 
957 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  28.4 
 
 
853 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  29.85 
 
 
1082 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.57 
 
 
602 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.98 
 
 
413 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  25.95 
 
 
391 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.04 
 
 
480 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  27.08 
 
 
426 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.92 
 
 
941 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  31.18 
 
 
474 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>