136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3125 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 411 aa  850    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  74.7 
 
 		 410 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  65.61 
 
 		 414 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  65.12 
 
 		 414 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  48.74 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  47.73 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  45.71 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  45.27 
 
 		 413 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  45.94 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  40.05 
 
 		 459 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  37.83 
 
 		 397 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  32.95 
 
 		 616 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  30.3 
 
 		 614 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  33.72 
 
 		 556 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  32.31 
 
 		 661 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  31.91 
 
 		 679 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  32.05 
 
 		 663 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  31.66 
 
 		 663 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 		 666 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  36.19 
 
 		 558 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3536  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.22 
 
 		 587 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.22 
 
 		 610 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.18 
 
 		 594 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.18 
 
 		 594 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.4 
 
 		 613 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.435912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  30.82 
 
 		 604 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.93 
 
 		 616 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0426  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.04 
 
 		 616 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2966  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.06 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.31 
 
 		 611 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2357  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.57 
 
 		 613 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2971  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.57 
 
 		 613 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 		 557 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.57 
 
 		 612 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2991  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.57 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.36 
 
 		 637 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3107  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.12 
 
 		 610 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.48 
 
 		 627 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.590205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2453  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.12 
 
 		 633 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.82 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2881  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.82 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.52 
 
 		 606 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.07 
 
 		 598 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  35.82 
 
 		 553 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.29 
 
 		 676 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0461  CBS/GGDEF/EAL domain-containing protein  33 
 
 		 594 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  22.65 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  35.43 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  33.08 
 
 		 592 aa  83.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  35.43 
 
 		 590 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.86 
 
 		 596 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  26.08 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2422  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.9 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.411965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  24.88 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0739  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.21 
 
 		 735 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.85 
 
 		 584 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  34.17 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.15 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.41 
 
 		 599 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  29.63 
 
 		 582 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  28.15 
 
 		 601 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.11 
 
 		 632 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.11 
 
 		 583 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.69 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.405196  hitchhiker  0.000791154 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.88 
 
 		 583 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.37 
 
 		 584 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  30.15 
 
 		 584 aa  67  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.67 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.68 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.66 
 
 		 766 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.68 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.15 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.56 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.68 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.68 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.93 
 
 		 753 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.74 
 
 		 605 aa  60.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  23.36 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  24.57 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2369  diguanylate cyclase  29.29 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34805  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  33.67 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  26.79 
 
 		 708 aa  57  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  23.18 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  22.76 
 
 		 559 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 		 584 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3632  histidine kinase  29.82 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  24.09 
 
 		 637 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.92 
 
 		 1023 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0543152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  22.61 
 
 		 648 aa  53.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.51 
 
 		 786 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  25.48 
 
 		 851 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  24.12 
 
 		 642 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.63 
 
 		 566 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  22.69 
 
 		 715 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  22.47 
 
 		 560 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  22.91 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  25 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  24.52 
 
 		 775 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  21.66 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1749  putative PAS/PAC sensor protein  21.43 
 
 		 377 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>