More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1749 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1749  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 377 aa  775    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  30.14 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  28.9 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0171  putative PAS/PAC sensor protein  25.26 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  26.02 
 
 		 559 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  24.87 
 
 		 373 aa  96.3  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  26.74 
 
 		 409 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  29.26 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1539  protein serine/threonine phosphatase  27.98 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.78 
 
 		 590 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  29.66 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.17 
 
 		 649 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  25.26 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.22 
 
 		 572 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  26.24 
 
 		 1087 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  28.15 
 
 		 644 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  28.17 
 
 		 404 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.47 
 
 		 602 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  24.94 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.3 
 
 		 1332 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  25.08 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  27.65 
 
 		 631 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  27.65 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.02 
 
 		 1079 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  27.72 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  25.86 
 
 		 1087 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  28.62 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  23.71 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  25.72 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  25.78 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  24.24 
 
 		 853 aa  80.1  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.75 
 
 		 684 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.76 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  26.94 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.14 
 
 		 957 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  25.19 
 
 		 687 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  24.55 
 
 		 775 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  28.3 
 
 		 648 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.71 
 
 		 526 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  26.72 
 
 		 708 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  25.19 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  25.68 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  23.04 
 
 		 560 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.55 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  25.78 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  25.78 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  25.78 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  25.84 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  26.3 
 
 		 1083 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.35 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  23.68 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2467  putative PAS/PAC sensor protein  23.18 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.91 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1246  putative PAS/PAC sensor protein  24.73 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  25.84 
 
 		 1100 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  26.05 
 
 		 1082 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.7 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  23.37 
 
 		 754 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  28.36 
 
 		 705 aa  73.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.79 
 
 		 606 aa  72.8  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  26.23 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  21.07 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  26.29 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  24.51 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  25.83 
 
 		 706 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.48 
 
 		 961 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  27.27 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  24.56 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  24.63 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  25.71 
 
 		 670 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  25.71 
 
 		 667 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  25.81 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  23.51 
 
 		 536 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  25.81 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  25.86 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.41 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.81 
 
 		 1480 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.19 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  24.54 
 
 		 1017 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  23.15 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  23.81 
 
 		 744 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.33 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  23.83 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  26.74 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  25.98 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  24.64 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  22.08 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.24 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0631  sigma factor regulatory protein, putative  25 
 
 		 708 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  25.57 
 
 		 708 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  23.25 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  24.81 
 
 		 612 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  24.02 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.62 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  25.46 
 
 		 634 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.91 
 
 		 563 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  27.23 
 
 		 557 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.62 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>