More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0393 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 413 aa  826    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  100 
 
 		 413 aa  826    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 413 aa  826    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  39.6 
 
 		 393 aa  246  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2748  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.36 
 
 		 399 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  40.65 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  40.65 
 
 		 516 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.89 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  37.92 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  41.84 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.63 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  31.55 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.24 
 
 		 941 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.03 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.03 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.48 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  30.38 
 
 		 1087 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4365  response regulator receiver protein  39.7 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.51 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.51 
 
 		 323 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.51 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.25 
 
 		 322 aa  123  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 323 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  40.88 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.51 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  42.14 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  30.45 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3900  serine phosphatase  40 
 
 		 642 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3974  stage II sporulation E family protein  40 
 
 		 661 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3915  stage II sporulation E family protein  40 
 
 		 661 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.688937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.48 
 
 		 572 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  41.11 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  29.3 
 
 		 1087 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  35.2 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  33.74 
 
 		 410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.62 
 
 		 327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  38.36 
 
 		 324 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  32.4 
 
 		 364 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  31.54 
 
 		 1082 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  35.48 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  38.1 
 
 		 441 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.78 
 
 		 781 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 680 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 681 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 878 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.55 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.12 
 
 		 531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  37.8 
 
 		 595 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.55 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 1965 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  35.45 
 
 		 637 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2618  putative PAS/PAC sensor protein  42.04 
 
 		 685 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  39.2 
 
 		 794 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 694 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  35.76 
 
 		 320 aa  110  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  40.99 
 
 		 327 aa  110  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.47 
 
 		 506 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3804  EAL domain-containing protein  41.98 
 
 		 598 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  39.13 
 
 		 743 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.06 
 
 		 780 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.89 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  32.33 
 
 		 853 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1550 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  36.75 
 
 		 314 aa  106  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  40.13 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.13 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0220  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  40.74 
 
 		 598 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.08 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  37.74 
 
 		 276 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  25.82 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  34.22 
 
 		 470 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  38.12 
 
 		 240 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  40.61 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  38.06 
 
 		 267 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  33.49 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  30.74 
 
 		 631 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.14 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.58 
 
 		 326 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  30.05 
 
 		 238 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  35.75 
 
 		 542 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  36.94 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.22 
 
 		 1079 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  32.07 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  36.69 
 
 		 669 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  33 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  32.35 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  34.64 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  26.93 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  32.8 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  41.13 
 
 		 607 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1600  GGDEF family protein  36.81 
 
 		 594 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723611  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.1 
 
 		 447 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>