More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1539 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1539  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
363 aa  741    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  31.06 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  33.03 
 
 
373 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  29.92 
 
 
360 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  28.51 
 
 
519 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  26.91 
 
 
467 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.09 
 
 
400 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  27.36 
 
 
443 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.41 
 
 
590 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  30.37 
 
 
455 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  27.05 
 
 
1087 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  27.05 
 
 
1087 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  25.09 
 
 
536 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  28.57 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  29.15 
 
 
404 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  26.33 
 
 
396 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  27.82 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  28.36 
 
 
410 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  26.38 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  26.86 
 
 
687 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 
634 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  27.86 
 
 
559 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  24.46 
 
 
649 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  25.38 
 
 
642 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1749  putative PAS/PAC sensor protein  27.98 
 
 
377 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  24.14 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.1 
 
 
496 aa  92.8  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.09 
 
 
380 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1246  putative PAS/PAC sensor protein  29.47 
 
 
508 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  28.23 
 
 
705 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5042  protein serine/threonine phosphatase  30.36 
 
 
502 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384072  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 
637 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.1 
 
 
748 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  27.21 
 
 
706 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  26.47 
 
 
683 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  24.76 
 
 
775 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  28.94 
 
 
631 aa  90.5  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.94 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  30.69 
 
 
394 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  30.22 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.78 
 
 
379 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  27.82 
 
 
705 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  25.56 
 
 
545 aa  89  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  27.24 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  22.4 
 
 
649 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.12 
 
 
486 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.11 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  24.31 
 
 
642 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  29.63 
 
 
394 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  30.32 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.05 
 
 
708 aa  87  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.67 
 
 
378 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.71 
 
 
384 aa  87  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  26.38 
 
 
846 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.7 
 
 
480 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  25.61 
 
 
472 aa  86.3  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.13 
 
 
560 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.81 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.38 
 
 
606 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  25.5 
 
 
648 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  25.43 
 
 
716 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  30.14 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  24.13 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  28.06 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  28 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  28.45 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.41 
 
 
566 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3986  serine phosphatase  27.39 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613472  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  30.89 
 
 
463 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  28.15 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  22.94 
 
 
697 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.89 
 
 
602 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.93 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  25.7 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  23.19 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0232  Stage II sporulation E family protein  24.88 
 
 
531 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66837  decreased coverage  0.000564491 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  27.78 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  23.68 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  25.12 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  27.69 
 
 
650 aa  80.9  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  30.15 
 
 
462 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.05 
 
 
572 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.68 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.38 
 
 
585 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  27.6 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  25 
 
 
1079 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  26.69 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  26.69 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  26.67 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  23.65 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  25.41 
 
 
1100 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  23.37 
 
 
560 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.67 
 
 
465 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  23.14 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  21.69 
 
 
502 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  20.73 
 
 
637 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  26.8 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  26.67 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  24.77 
 
 
509 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>