More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5042 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5042  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 502 aa  1008    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  37.22 
 
 		 715 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6569  protein serine/threonine phosphatase  44.61 
 
 		 556 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  34.21 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  33.47 
 
 		 397 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  31.97 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  33.07 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2574  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 		 496 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840263 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  35.08 
 
 		 684 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.87 
 
 		 1087 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  31.87 
 
 		 1087 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 		 649 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  31.25 
 
 		 1082 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  30.63 
 
 		 705 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  29.66 
 
 		 644 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.52 
 
 		 590 aa  107  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.08 
 
 		 706 aa  107  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  29.64 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  27.88 
 
 		 705 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  31.62 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.24 
 
 		 612 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  28.11 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  30.6 
 
 		 649 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  35.35 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1539  protein serine/threonine phosphatase  30.36 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  28.93 
 
 		 716 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.17 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  32.69 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  28.14 
 
 		 648 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.39 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  28.29 
 
 		 1079 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.81 
 
 		 1332 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  26.54 
 
 		 683 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.67 
 
 		 602 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  34.54 
 
 		 853 aa  97.8  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  31.25 
 
 		 708 aa  97.8  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  29.3 
 
 		 723 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 		 642 aa  97.8  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  30.38 
 
 		 643 aa  97.1  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3700  serine phosphatase  28.35 
 
 		 385 aa  96.7  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  30.38 
 
 		 657 aa  96.7  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  28.51 
 
 		 637 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  29.23 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  31.75 
 
 		 365 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  29.32 
 
 		 754 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  29.96 
 
 		 846 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  32.62 
 
 		 502 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  29.37 
 
 		 1100 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  29.34 
 
 		 1083 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  31.85 
 
 		 262 aa  94  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.71 
 
 		 961 aa  94  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.17 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.88 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  29.5 
 
 		 642 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  31.7 
 
 		 1194 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  28.36 
 
 		 521 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  23.94 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.28 
 
 		 748 aa  91.3  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.55 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 		 775 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24 
 
 		 486 aa  90.1  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  27.97 
 
 		 404 aa  90.1  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  29 
 
 		 683 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  29.01 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  27.71 
 
 		 631 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  28.1 
 
 		 630 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  25.55 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  29.21 
 
 		 519 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  27.63 
 
 		 840 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  27.75 
 
 		 660 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  27.4 
 
 		 687 aa  87  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  25.22 
 
 		 379 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  28.52 
 
 		 373 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5997  protein serine/threonine phosphatase  26.87 
 
 		 774 aa  86.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.36 
 
 		 688 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  33.7 
 
 		 770 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  28.05 
 
 		 360 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.11 
 
 		 957 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  25.79 
 
 		 678 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  31.72 
 
 		 754 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  28.46 
 
 		 645 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.88 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 1385 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  31.4 
 
 		 828 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  26.24 
 
 		 643 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  27.44 
 
 		 474 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.11 
 
 		 400 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.72 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  34 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  30.12 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  26.4 
 
 		 634 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  22.46 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  29.84 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 1361 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  34.64 
 
 		 851 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.68 
 
 		 995 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  30.96 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  24 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>