More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2574 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2574  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
496 aa  985    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  29.21 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 
404 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.21 
 
 
563 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5042  protein serine/threonine phosphatase  33.61 
 
 
502 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384072  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  32 
 
 
400 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 
715 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  29.12 
 
 
649 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6569  protein serine/threonine phosphatase  32.88 
 
 
556 aa  103  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400187  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.74 
 
 
678 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.96 
 
 
961 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  29.1 
 
 
397 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  29.78 
 
 
451 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.61 
 
 
649 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  27.92 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  26.59 
 
 
404 aa  93.6  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.06 
 
 
957 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  24.48 
 
 
362 aa  91.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  26.32 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.57 
 
 
516 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  28.9 
 
 
643 aa  90.9  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.17 
 
 
606 aa  90.9  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  26.28 
 
 
631 aa  90.1  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.72 
 
 
507 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  25.87 
 
 
536 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  25.39 
 
 
612 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  29.91 
 
 
467 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.98 
 
 
1079 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  24.92 
 
 
708 aa  87.4  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.09 
 
 
486 aa  87  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  30.63 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  26.79 
 
 
708 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
637 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  26.82 
 
 
644 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  24.91 
 
 
521 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  29.55 
 
 
543 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  29.02 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.23 
 
 
566 aa  84.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  26.3 
 
 
775 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  28.73 
 
 
667 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.57 
 
 
378 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  28.73 
 
 
670 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.73 
 
 
385 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.32 
 
 
590 aa  82.4  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  25.93 
 
 
1082 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  32.37 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  26.91 
 
 
754 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  27.8 
 
 
716 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.11 
 
 
1332 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  27.76 
 
 
1087 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  28.81 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  26.5 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  27.76 
 
 
1087 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  27.27 
 
 
1100 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.64 
 
 
706 aa  80.5  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.47 
 
 
792 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.07 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  23.76 
 
 
705 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  27.71 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  29.64 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  31.12 
 
 
361 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.91 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.91 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.86 
 
 
748 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  27.63 
 
 
710 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.46 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  27.24 
 
 
687 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.98 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  28.52 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  27.2 
 
 
637 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  28.14 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  28.96 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  25.44 
 
 
723 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  27.91 
 
 
642 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  23.99 
 
 
648 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.09 
 
 
1480 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  27.91 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  28.06 
 
 
853 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  27 
 
 
967 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  27 
 
 
967 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  25.45 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  25.45 
 
 
657 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  25.83 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  25.99 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.91 
 
 
465 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.83 
 
 
997 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  29.48 
 
 
671 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  26.5 
 
 
645 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  30.77 
 
 
683 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  24.81 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  28.24 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  29.41 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  27.07 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  27.73 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.96 
 
 
486 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.33 
 
 
467 aa  73.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  26.36 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  27.56 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>