More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0838 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  56.18 
 
 		 753 aa  778    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  56.89 
 
 		 765 aa  750    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  61.42 
 
 		 743 aa  877    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  61.04 
 
 		 744 aa  885    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 754 aa  1515    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  36.1 
 
 		 776 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 		 713 aa  248  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 		 697 aa  235  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  30.78 
 
 		 817 aa  230  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.29 
 
 		 573 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.66 
 
 		 1045 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.71 
 
 		 952 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.38 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  30.64 
 
 		 591 aa  209  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  29.86 
 
 		 855 aa  208  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  29.64 
 
 		 722 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 		 1039 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.02 
 
 		 616 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 		 594 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  33.99 
 
 		 1432 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  41.02 
 
 		 643 aa  177  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 1225 aa  168  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  39.72 
 
 		 713 aa  163  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.94 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  29.23 
 
 		 574 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.3 
 
 		 750 aa  162  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  30.02 
 
 		 723 aa  157  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.06 
 
 		 745 aa  153  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  28.79 
 
 		 570 aa  153  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 		 581 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  27.74 
 
 		 716 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  27.97 
 
 		 618 aa  151  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  28.87 
 
 		 607 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 1711 aa  144  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  28.82 
 
 		 688 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  26.9 
 
 		 585 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.85 
 
 		 583 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  30.7 
 
 		 528 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  29.69 
 
 		 866 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  31.22 
 
 		 685 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  30.14 
 
 		 693 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 1370 aa  131  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.89 
 
 		 688 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  29.33 
 
 		 1100 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.94 
 
 		 693 aa  128  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  28.17 
 
 		 932 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  29.5 
 
 		 865 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  27.56 
 
 		 562 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 		 583 aa  128  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  27.76 
 
 		 760 aa  128  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1248 aa  127  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  32.82 
 
 		 692 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  29.43 
 
 		 580 aa  127  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  29.38 
 
 		 721 aa  125  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 		 700 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6792  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.66 
 
 		 585 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.8 
 
 		 697 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0169  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.75 
 
 		 711 aa  124  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00160079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  28.6 
 
 		 746 aa  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 		 572 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 637 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0106  PAS protein phosphatase 2C-like  28.35 
 
 		 670 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  36.48 
 
 		 851 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  28.37 
 
 		 771 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  28.76 
 
 		 730 aa  121  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.68 
 
 		 692 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  32.3 
 
 		 614 aa  120  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  29.33 
 
 		 757 aa  120  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  28.93 
 
 		 537 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  29.62 
 
 		 607 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.05 
 
 		 655 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  34.46 
 
 		 1017 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1390 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1390 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.22 
 
 		 553 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1390 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  28.82 
 
 		 366 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 1385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  27.81 
 
 		 805 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 1361 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  26.54 
 
 		 956 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.52 
 
 		 538 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.73 
 
 		 847 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  30.23 
 
 		 828 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  27.63 
 
 		 1087 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  27.84 
 
 		 1087 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 		 547 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.41 
 
 		 830 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.41 
 
 		 549 aa  114  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.72 
 
 		 1332 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  27.85 
 
 		 694 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.48 
 
 		 453 aa  111  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.65 
 
 		 775 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  29.47 
 
 		 658 aa  110  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 		 627 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  25.47 
 
 		 1082 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  37.12 
 
 		 260 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.52 
 
 		 961 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  27.48 
 
 		 1079 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>