More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1522 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 		 378 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  76.19 
 
 		 393 aa  607  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  76.19 
 
 		 393 aa  607  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  61.02 
 
 		 967 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  61.02 
 
 		 967 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  52.56 
 
 		 682 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  61.42 
 
 		 705 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  58.27 
 
 		 667 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  58.27 
 
 		 670 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  57.92 
 
 		 840 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  54.9 
 
 		 817 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  54.9 
 
 		 817 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  53.48 
 
 		 521 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  56.79 
 
 		 251 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  51.74 
 
 		 663 aa  276  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  54.12 
 
 		 786 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  50 
 
 		 785 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  48.82 
 
 		 786 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  35.82 
 
 		 389 aa  185  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3967  putative response regulator of a two-component system  59.4 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000645274  normal  0.0110626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1436  two-component response regulator  58.65 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16500  two-component response regulator  58.65 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  57.14 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4124  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  54.42 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  56.3 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1099  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  59.06 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1494  response regulator/GGDEF domain-containing protein  58.27 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.799611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  58.27 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1499  response regulator/GGDEF domain protein  53.74 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5389  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  54.11 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1309  GGDEF  58.27 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1058  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  59.06 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0856452  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3470  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  54.23 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843913  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  54.23 
 
 		 345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4311  diguanylate cyclase  53.52 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4055  diguanylate cyclase  53.52 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2018  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  52.82 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  58.68 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  58.68 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  58.68 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  58.68 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  58.68 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  58.68 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  58.68 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  58.68 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3449  diguanylate cyclase  52.11 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3956  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  52.11 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.892783  normal  0.485051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.02 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.02 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.02 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.02 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.02 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  56.56 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  57.02 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.2 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  32.82 
 
 		 630 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  32.82 
 
 		 630 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  32.82 
 
 		 630 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0420  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 172 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.370245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  32.2 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  33.2 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  31.77 
 
 		 633 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  31.23 
 
 		 1087 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.23 
 
 		 1087 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  27.87 
 
 		 404 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  30.56 
 
 		 1100 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  29.85 
 
 		 754 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  30.04 
 
 		 1079 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.89 
 
 		 684 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 		 536 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.53 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.94 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27.9 
 
 		 649 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.96 
 
 		 637 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.93 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.53 
 
 		 526 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  29.37 
 
 		 1083 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.03 
 
 		 957 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.41 
 
 		 486 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.06 
 
 		 1332 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  26.82 
 
 		 642 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  24.92 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.81 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  26.11 
 
 		 434 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  30.08 
 
 		 637 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.1 
 
 		 572 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  27.76 
 
 		 642 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  27.2 
 
 		 853 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.68 
 
 		 516 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.59 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  28.47 
 
 		 705 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0020  stage II sporulation E family protein  26.89 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  29.12 
 
 		 775 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.65 
 
 		 961 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  29.1 
 
 		 708 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.5 
 
 		 590 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  28.37 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  27.6 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>