More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0216 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 364 aa  737    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  99.45 
 
 		 364 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  97.8 
 
 		 364 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  99.73 
 
 		 365 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  99.73 
 
 		 365 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  99.73 
 
 		 365 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  99.73 
 
 		 364 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  99.73 
 
 		 365 aa  734    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  77.65 
 
 		 377 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  77.93 
 
 		 377 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  77.93 
 
 		 377 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  77.93 
 
 		 363 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  77.09 
 
 		 363 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  77.09 
 
 		 377 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  76.54 
 
 		 377 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16500  two-component response regulator  64.93 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1436  two-component response regulator  67.19 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462819  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3967  putative response regulator of a two-component system  63.19 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000645274  normal  0.0110626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1494  response regulator/GGDEF domain-containing protein  60.27 
 
 		 335 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.799611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  60.27 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4124  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  64.66 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1309  GGDEF  58.9 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1099  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  59.59 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1499  response regulator/GGDEF domain protein  58.9 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5389  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  66.15 
 
 		 372 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  65.38 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1058  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  62.88 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0856452  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3470  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  58.97 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843913  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  58.39 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3956  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  60.26 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.892783  normal  0.485051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3449  diguanylate cyclase  60.26 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4311  diguanylate cyclase  64.84 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4055  diguanylate cyclase  64.84 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  54.55 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2018  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  64.06 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  61.94 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  61.94 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  64.06 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 795 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 794 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  41.95 
 
 		 795 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 795 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 795 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 819 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 799 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  58.68 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 828 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 795 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 795 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  39.34 
 
 		 797 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  39.81 
 
 		 759 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  39.34 
 
 		 797 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  39.34 
 
 		 797 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  39.34 
 
 		 797 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0420  response regulator receiver protein  49.24 
 
 		 172 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.370245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  39.34 
 
 		 797 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  39.34 
 
 		 797 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  39.34 
 
 		 797 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  39.71 
 
 		 784 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 829 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 777 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 754 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 757 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 777 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  38.61 
 
 		 751 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  36.89 
 
 		 789 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.26 
 
 		 1152 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  37.62 
 
 		 766 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 645 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  34.78 
 
 		 639 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 785 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 1002 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  29.19 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 1003 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  31.51 
 
 		 457 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  31.05 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  31.05 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  31.05 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  31.05 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  31.05 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  31.05 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  31.05 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  31.05 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  31.51 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 776 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>