More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2304 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
786 aa  1596    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  91.73 
 
 
785 aa  1439    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  70.25 
 
 
786 aa  1098    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 
705 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  48.93 
 
 
817 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  48.93 
 
 
817 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 
967 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 
967 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  45.67 
 
 
840 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  45.36 
 
 
670 aa  263  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  45.36 
 
 
667 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.74 
 
 
393 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.74 
 
 
393 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  48.82 
 
 
378 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  40.94 
 
 
663 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  39.09 
 
 
682 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  45.27 
 
 
251 aa  224  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  42.31 
 
 
521 aa  210  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  26.19 
 
 
708 aa  157  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  25.25 
 
 
705 aa  146  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  23.82 
 
 
705 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  29.91 
 
 
630 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 
630 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 
630 aa  128  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  31.2 
 
 
366 aa  125  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  32.14 
 
 
1087 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  25 
 
 
687 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  23.51 
 
 
716 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.77 
 
 
1079 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  23.31 
 
 
706 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  24.44 
 
 
648 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  31.35 
 
 
1087 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  29.59 
 
 
633 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  31.35 
 
 
1100 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  31.08 
 
 
853 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  31.37 
 
 
462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.37 
 
 
957 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.2 
 
 
678 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  23.85 
 
 
649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  24.59 
 
 
644 aa  114  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 
642 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.95 
 
 
1332 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.29 
 
 
642 aa  111  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.26 
 
 
961 aa  111  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.11 
 
 
748 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  29.14 
 
 
649 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  30.21 
 
 
543 aa  109  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  24.53 
 
 
885 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.49 
 
 
637 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  28.38 
 
 
642 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  26.96 
 
 
710 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  33.58 
 
 
846 aa  104  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  26.02 
 
 
1083 aa  104  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.23 
 
 
480 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  27.67 
 
 
661 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  27.23 
 
 
723 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  31.73 
 
 
637 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.58 
 
 
516 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  25.61 
 
 
643 aa  102  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  29.69 
 
 
410 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  28.74 
 
 
754 aa  101  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  30.31 
 
 
536 aa  101  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  24.83 
 
 
650 aa  100  9e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  25.52 
 
 
657 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  29.8 
 
 
671 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 
775 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.96 
 
 
1480 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.23 
 
 
684 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  30.35 
 
 
404 aa  99.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  29.8 
 
 
477 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0020  stage II sporulation E family protein  31.71 
 
 
464 aa  98.2  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329951  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  30.26 
 
 
378 aa  97.8  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.57 
 
 
572 aa  97.8  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  26.26 
 
 
1082 aa  97.8  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.07 
 
 
423 aa  97.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  28.73 
 
 
708 aa  96.3  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.33 
 
 
482 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  27.82 
 
 
381 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  31.05 
 
 
396 aa  95.5  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  32.27 
 
 
451 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  27.7 
 
 
454 aa  95.5  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  26.13 
 
 
645 aa  95.1  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.15 
 
 
467 aa  94.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  28.52 
 
 
460 aa  94.7  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  28.78 
 
 
465 aa  94.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  29.23 
 
 
443 aa  94.4  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  28.41 
 
 
463 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  26.82 
 
 
474 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  26.89 
 
 
663 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.94 
 
 
1004 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  28.25 
 
 
438 aa  93.2  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  26.13 
 
 
660 aa  92.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  32.7 
 
 
612 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0033  sensor protein  26.43 
 
 
599 aa  92  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.874201  hitchhiker  0.00904791 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.41 
 
 
465 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  26.89 
 
 
663 aa  92  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  28.29 
 
 
521 aa  92  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  28.48 
 
 
474 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  28.48 
 
 
474 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  29.43 
 
 
445 aa  91.3  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>