More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1586 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  65.39 
 
 
910 aa  1110    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  55.49 
 
 
1082 aa  1165    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  62.26 
 
 
1100 aa  1306    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  51.63 
 
 
671 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  100 
 
 
1087 aa  2210    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  97.06 
 
 
1087 aa  2100    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  67.1 
 
 
1079 aa  1477    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  54.6 
 
 
1083 aa  1179    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 
919 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  44.87 
 
 
927 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  42.4 
 
 
919 aa  545  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.11 
 
 
1088 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  42.22 
 
 
906 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  42.52 
 
 
913 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  43.59 
 
 
903 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
1071 aa  505  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
920 aa  499  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
917 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
932 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  42.78 
 
 
935 aa  476  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  43.77 
 
 
1039 aa  476  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
897 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 
901 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  40.36 
 
 
1323 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 
1323 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
894 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  37.25 
 
 
894 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 
1172 aa  439  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 
945 aa  439  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
1316 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
894 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 
1069 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
1169 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
1069 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
1070 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
1070 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1163 aa  399  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  36.79 
 
 
1174 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
1169 aa  393  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
896 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
1170 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1172 aa  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  34.74 
 
 
950 aa  389  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  37.19 
 
 
1145 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.71 
 
 
1158 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
1169 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  36.99 
 
 
1169 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  37.71 
 
 
1157 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 
1177 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
1171 aa  383  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
1159 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  36.77 
 
 
1159 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
1156 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
1152 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
1146 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  37.11 
 
 
1146 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
893 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
1168 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
1169 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
1146 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1168 aa  379  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  36.77 
 
 
1159 aa  380  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
1168 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1167 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
1174 aa  376  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
1159 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
1145 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
1158 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
1146 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
1159 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.8 
 
 
1168 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  37.92 
 
 
1150 aa  373  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1146 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.34 
 
 
1169 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  36.59 
 
 
1142 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1140 aa  365  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1140 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.1 
 
 
1179 aa  363  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
1146 aa  363  8e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1159 aa  361  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1175 aa  361  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
1168 aa  360  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  36.88 
 
 
1161 aa  359  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
1172 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
1146 aa  357  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  35.72 
 
 
1147 aa  356  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
1140 aa  355  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  47.34 
 
 
366 aa  342  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  36.14 
 
 
1148 aa  342  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  35.78 
 
 
1177 aa  338  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.11 
 
 
1156 aa  336  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  35.6 
 
 
1141 aa  333  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1145 aa  328  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
885 aa  323  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.7 
 
 
1184 aa  310  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1161 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1185 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
1166 aa  303  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  55.47 
 
 
637 aa  293  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 
1138 aa  290  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>