More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0869 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.03 
 
 		 1159 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  47.45 
 
 		 1157 aa  663    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  47.58 
 
 		 1158 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  48.49 
 
 		 1161 aa  666    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.8 
 
 		 1156 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.03 
 
 		 1158 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.03 
 
 		 1159 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  50.13 
 
 		 1159 aa  693    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  45.06 
 
 		 1147 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.57 
 
 		 1172 aa  716    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  44.39 
 
 		 1150 aa  636    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.77 
 
 		 1159 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1316 aa  2676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  50 
 
 		 1159 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 		 1152 aa  649    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  45.15 
 
 		 1177 aa  628  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  44.94 
 
 		 1148 aa  629  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 		 1175 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 		 1168 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 		 1172 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 		 1168 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.3 
 
 		 1168 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  42.95 
 
 		 1179 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  47.26 
 
 		 919 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 		 1170 aa  591  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  41.65 
 
 		 1145 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 		 1146 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 1146 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  41.61 
 
 		 1146 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47 
 
 		 919 aa  582  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.98 
 
 		 1145 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 		 1145 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  40.2 
 
 		 1169 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 		 1169 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 1146 aa  576  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 		 1140 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 		 1146 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 		 1172 aa  569  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  41.7 
 
 		 1142 aa  566  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  42.17 
 
 		 1141 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 1169 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  46.9 
 
 		 927 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 		 1169 aa  563  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 1163 aa  562  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 1146 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 1146 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.72 
 
 		 1168 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  38.19 
 
 		 1147 aa  556  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 		 1167 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 1140 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  45.18 
 
 		 913 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 		 1140 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 		 1159 aa  548  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  42.71 
 
 		 1055 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 1169 aa  549  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 1168 aa  545  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 917 aa  545  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 		 1177 aa  545  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.34 
 
 		 1156 aa  541  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 1174 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  41.68 
 
 		 1174 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  39.75 
 
 		 1169 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 1171 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  44.78 
 
 		 903 aa  534  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1138 aa  535  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 1152 aa  533  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 932 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1166 aa  513  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  41.78 
 
 		 906 aa  506  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.14 
 
 		 1088 aa  505  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 1161 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  45.66 
 
 		 935 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 		 920 aa  499  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1185 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.06 
 
 		 1184 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  40.81 
 
 		 910 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 901 aa  469  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  38.56 
 
 		 1079 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  42.25 
 
 		 881 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  41 
 
 		 868 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.69 
 
 		 854 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  40.4 
 
 		 1087 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  34.71 
 
 		 1006 aa  446  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  40.03 
 
 		 671 aa  445  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 896 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 897 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  39.29 
 
 		 894 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 894 aa  439  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  39.1 
 
 		 1039 aa  436  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  39.72 
 
 		 1087 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 854 aa  432  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 893 aa  433  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 894 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  37.5 
 
 		 842 aa  426  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 945 aa  426  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 856 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  37.78 
 
 		 1100 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  35.02 
 
 		 1082 aa  416  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 		 645 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>