More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2829 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.43 
 
 		 1159 aa  1105    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  51.55 
 
 		 1161 aa  1108    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1167 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.73 
 
 		 1158 aa  1109    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 1145 aa  953    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.98 
 
 		 1156 aa  882    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.85 
 
 		 1168 aa  751    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.43 
 
 		 1152 aa  873    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.02 
 
 		 1184 aa  771    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  38.91 
 
 		 1174 aa  764    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 		 1171 aa  782    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  44.29 
 
 		 1145 aa  960    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  38.29 
 
 		 1169 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 1172 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  42.34 
 
 		 1150 aa  869    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  50.26 
 
 		 1157 aa  1096    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 		 1146 aa  934    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.21 
 
 		 1169 aa  730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 1111 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 		 1172 aa  976    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  50.22 
 
 		 1158 aa  1090    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  45.79 
 
 		 1141 aa  957    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 		 1140 aa  942    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.73 
 
 		 1179 aa  773    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 		 1146 aa  954    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 1169 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  36.77 
 
 		 1147 aa  754    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 		 1161 aa  843    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  52.11 
 
 		 1156 aa  1124    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 		 1146 aa  957    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  100 
 
 		 1148 aa  2330    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  73.79 
 
 		 1055 aa  1623    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  51.68 
 
 		 1159 aa  1124    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.51 
 
 		 1159 aa  1101    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 1170 aa  778    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 1152 aa  744    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.85 
 
 		 1159 aa  1106    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 		 1146 aa  958    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1169 aa  725    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 1177 aa  706    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 1168 aa  736    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  45.52 
 
 		 1142 aa  968    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 1169 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 		 1175 aa  775    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  73.77 
 
 		 1177 aa  1751    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 1168 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 1174 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 1169 aa  745    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  73.39 
 
 		 1147 aa  1719    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1145 aa  806    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 		 1140 aa  947    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1138 aa  719    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1163 aa  778    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.78 
 
 		 1159 aa  956    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1166 aa  837    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 		 1146 aa  959    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1168 aa  785    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 1172 aa  781    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 1146 aa  938    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.65 
 
 		 1140 aa  957    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 1185 aa  773    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 1168 aa  784    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  44.28 
 
 		 1146 aa  955    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  51.59 
 
 		 1159 aa  1120    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 		 1316 aa  633  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  37.02 
 
 		 1006 aa  634  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1116 aa  626  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  41.41 
 
 		 927 aa  469  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  41.35 
 
 		 919 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 917 aa  452  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  40.14 
 
 		 913 aa  442  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 932 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  41.92 
 
 		 935 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 919 aa  426  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  40.49 
 
 		 903 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 880 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  40.72 
 
 		 881 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 920 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 883 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 545 aa  386  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  39.69 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.58 
 
 		 1088 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  35.29 
 
 		 906 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 901 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 897 aa  366  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  34.17 
 
 		 1082 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 945 aa  359  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  36.52 
 
 		 910 aa  356  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 884 aa  355  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 894 aa  354  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 884 aa  355  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 896 aa  354  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  37.39 
 
 		 1087 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  36.52 
 
 		 894 aa  353  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  37.56 
 
 		 1087 aa  353  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 1071 aa  352  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  37.02 
 
 		 1039 aa  350  8e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 893 aa  347  6e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  36.27 
 
 		 1079 aa  346  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  34.23 
 
 		 1083 aa  343  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>