199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1429 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  100 
 
 
910 aa  1848    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  65.39 
 
 
1087 aa  1114    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  82.93 
 
 
1100 aa  1428    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  54.46 
 
 
671 aa  729    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  59.72 
 
 
1082 aa  997    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  65.04 
 
 
1087 aa  1106    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  58.18 
 
 
1083 aa  990    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  73.75 
 
 
1079 aa  1304    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 
919 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  49.01 
 
 
1088 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  45.73 
 
 
927 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  44.94 
 
 
919 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  41.27 
 
 
906 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  43.5 
 
 
913 aa  538  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  43.45 
 
 
903 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 
920 aa  531  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  44.06 
 
 
935 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
917 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  44.18 
 
 
1039 aa  511  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 
1071 aa  512  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  44.39 
 
 
1323 aa  505  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
932 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
901 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.6 
 
 
1323 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
1172 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
945 aa  469  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 
1316 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
897 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
894 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  38.83 
 
 
894 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
894 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
1170 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
1069 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
1069 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 
1169 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.88 
 
 
1070 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
896 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
1070 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 
1169 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
1163 aa  412  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
893 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
1169 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  36.62 
 
 
1150 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
1168 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.65 
 
 
1168 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  34.61 
 
 
950 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  35.16 
 
 
1169 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1152 aa  395  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
1169 aa  396  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1168 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  36.73 
 
 
1174 aa  392  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  36.9 
 
 
1159 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  36.9 
 
 
1159 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
1167 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
1174 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 
1168 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
1171 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
1156 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
1159 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.1 
 
 
1158 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
1158 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
1172 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
1175 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
1172 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  34.86 
 
 
1157 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  36.83 
 
 
1161 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
1159 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
1168 aa  373  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
1159 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
1177 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.91 
 
 
1169 aa  369  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.46 
 
 
1179 aa  365  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  34.38 
 
 
1145 aa  360  6e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
1177 aa  357  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  36.42 
 
 
1142 aa  355  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  35.95 
 
 
1147 aa  354  5e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1146 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1146 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  33.43 
 
 
1146 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1140 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1146 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1140 aa  348  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1146 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
1145 aa  349  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1159 aa  346  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
885 aa  345  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  36.21 
 
 
1148 aa  345  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1146 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
1140 aa  337  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1146 aa  336  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.13 
 
 
1156 aa  323  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  33.28 
 
 
1141 aa  322  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
1185 aa  317  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
1145 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.92 
 
 
1184 aa  307  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1138 aa  303  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
1166 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  35.46 
 
 
1055 aa  300  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 
1161 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  34.05 
 
 
1006 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>