More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0068 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 1159 aa  857    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 		 1158 aa  876    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  41.93 
 
 		 1142 aa  876    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 		 1140 aa  857    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 1156 aa  2355    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.44 
 
 		 1168 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  36.45 
 
 		 1150 aa  698    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  53.65 
 
 		 1184 aa  1252    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1175 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  36.14 
 
 		 1174 aa  670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  42.55 
 
 		 1145 aa  910    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 		 1145 aa  907    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.59 
 
 		 1169 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  42.16 
 
 		 1157 aa  881    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  55.12 
 
 		 1166 aa  1286    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  34.29 
 
 		 1147 aa  648    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 1152 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  55.84 
 
 		 1161 aa  1307    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.68 
 
 		 1158 aa  863    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  41.36 
 
 		 1147 aa  853    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1152 aa  736    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 1171 aa  668    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.39 
 
 		 1179 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 		 1146 aa  900    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.39 
 
 		 1156 aa  879    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 1146 aa  894    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  34.7 
 
 		 1169 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  39.22 
 
 		 1055 aa  762    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 		 1159 aa  854    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1167 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 1159 aa  880    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  41.97 
 
 		 1141 aa  875    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1169 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  41.98 
 
 		 1148 aa  853    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1168 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  40.76 
 
 		 1177 aa  844    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 1169 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  43.32 
 
 		 1159 aa  905    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.07 
 
 		 1159 aa  865    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 1169 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 1170 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1168 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1169 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1140 aa  876    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1145 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 1174 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1138 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 1163 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 		 1146 aa  898    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 1168 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1172 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 		 1146 aa  880    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  42.6 
 
 		 1161 aa  872    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.92 
 
 		 1140 aa  891    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  54.22 
 
 		 1185 aa  1258    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 1168 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 		 1146 aa  899    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  43.49 
 
 		 1159 aa  907    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  42.5 
 
 		 1146 aa  899    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1172 aa  809    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.93 
 
 		 1146 aa  875    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 1172 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 1177 aa  616  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  35.15 
 
 		 1006 aa  568  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 1111 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 1116 aa  553  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 1316 aa  526  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  36.7 
 
 		 927 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  37.48 
 
 		 919 aa  389  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  35.54 
 
 		 913 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 932 aa  370  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 920 aa  363  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 917 aa  360  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 919 aa  358  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.4 
 
 		 1088 aa  351  5e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  37.62 
 
 		 881 aa  344  5.999999999999999e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  37.34 
 
 		 545 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  36.26 
 
 		 903 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 880 aa  342  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 545 aa  341  5.9999999999999996e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  32.71 
 
 		 906 aa  339  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  35.57 
 
 		 935 aa  339  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 901 aa  330  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  35.92 
 
 		 1087 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  34 
 
 		 1079 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  34.11 
 
 		 1087 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 		 1323 aa  325  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 		 883 aa  324  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 897 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  33.05 
 
 		 1083 aa  319  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 893 aa  316  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  33.02 
 
 		 1039 aa  314  6.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  32.03 
 
 		 910 aa  313  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 884 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 884 aa  311  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  33.02 
 
 		 894 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 894 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 896 aa  305  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  39.13 
 
 		 950 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 894 aa  301  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>