More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  79.12 
 
 		 1159 aa  1870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  79.11 
 
 		 1161 aa  1871    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  79.03 
 
 		 1159 aa  1859    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  43.49 
 
 		 1156 aa  907    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.81 
 
 		 1168 aa  828    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 		 1177 aa  721    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 1169 aa  769    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.25 
 
 		 1184 aa  815    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  42.15 
 
 		 1174 aa  817    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.5 
 
 		 1146 aa  1009    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  47.17 
 
 		 1145 aa  1033    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  50.91 
 
 		 1147 aa  1102    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  40.22 
 
 		 1169 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  47.93 
 
 		 1142 aa  1026    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  79.4 
 
 		 1157 aa  1890    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.92 
 
 		 1172 aa  1034    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 1161 aa  850    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  78.62 
 
 		 1158 aa  1862    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.5 
 
 		 1145 aa  1029    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 1166 aa  830    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.66 
 
 		 1140 aa  1011    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  49.81 
 
 		 1055 aa  1013    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.72 
 
 		 1146 aa  1029    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.81 
 
 		 1146 aa  1028    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 1175 aa  837    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  81.9 
 
 		 1156 aa  1939    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  79.03 
 
 		 1159 aa  1872    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  51.59 
 
 		 1148 aa  1093    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  78.43 
 
 		 1158 aa  1860    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.53 
 
 		 1179 aa  827    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 1152 aa  798    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 		 1170 aa  811    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 1111 aa  689    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.72 
 
 		 1146 aa  1029    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 		 1169 aa  747    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1116 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 1172 aa  747    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  48.06 
 
 		 1141 aa  1019    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 1174 aa  805    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  40.02 
 
 		 1169 aa  778    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 		 1169 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1168 aa  796    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  47.55 
 
 		 1146 aa  1026    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 		 1152 aa  884    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 		 1168 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1316 aa  676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 		 1169 aa  767    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.95 
 
 		 1171 aa  819    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  99.57 
 
 		 1159 aa  2335    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 1145 aa  796    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 1138 aa  773    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 		 1163 aa  832    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  50.09 
 
 		 1177 aa  1082    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 		 1159 aa  1037    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.55 
 
 		 1146 aa  1032    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 1168 aa  837    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1172 aa  833    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.07 
 
 		 1146 aa  1011    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 1167 aa  806    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.2 
 
 		 1140 aa  1028    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 		 1185 aa  821    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 1168 aa  840    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  38.39 
 
 		 1006 aa  670    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  100 
 
 		 1159 aa  2342    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  43.43 
 
 		 1150 aa  866    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  38.91 
 
 		 1147 aa  766    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.21 
 
 		 1140 aa  1034    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  45.07 
 
 		 919 aa  482  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  44.18 
 
 		 927 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 919 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  42.94 
 
 		 903 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  43.06 
 
 		 913 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  31.9 
 
 		 1323 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  44.82 
 
 		 935 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.95 
 
 		 1088 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 917 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 		 920 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 932 aa  435  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  37.65 
 
 		 906 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 897 aa  425  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 901 aa  416  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  40.31 
 
 		 894 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 945 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 896 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 893 aa  406  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 894 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 894 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  38.32 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  41.85 
 
 		 881 aa  392  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 880 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  38.42 
 
 		 910 aa  380  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  41.09 
 
 		 545 aa  379  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  38.31 
 
 		 1087 aa  376  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 1071 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 		 883 aa  373  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  38.58 
 
 		 1082 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  38.23 
 
 		 1087 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  37.98 
 
 		 1039 aa  372  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  37.52 
 
 		 1079 aa  369  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>