More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0262 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  97.61 
 
 		 545 aa  1077    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  68.08 
 
 		 881 aa  751    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.92 
 
 		 883 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 545 aa  1110    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.29 
 
 		 880 aa  663    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.48 
 
 		 884 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.48 
 
 		 884 aa  617  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  43.07 
 
 		 1161 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  42.03 
 
 		 1157 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 1172 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  39.69 
 
 		 1148 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  39.92 
 
 		 1055 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  39.59 
 
 		 1142 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  41.46 
 
 		 1159 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  39.66 
 
 		 1177 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1159 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 		 1156 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 1140 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  41.09 
 
 		 1159 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.23 
 
 		 1158 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  39.02 
 
 		 1147 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 		 1146 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 		 1140 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 		 1146 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  39.73 
 
 		 1145 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  39.35 
 
 		 1146 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1146 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1146 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 		 1146 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 1140 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 		 1146 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 		 1152 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  40.34 
 
 		 1150 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  40.11 
 
 		 1141 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 1145 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 1138 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 		 1111 aa  363  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 1159 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 		 1159 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 1158 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1159 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.72 
 
 		 1179 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 1175 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1172 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1172 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.34 
 
 		 1156 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 		 1168 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1168 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 1177 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.18 
 
 		 1168 aa  330  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1161 aa  329  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  37.98 
 
 		 1169 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 		 1167 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 1174 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  39.66 
 
 		 1006 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1152 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1166 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1169 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.87 
 
 		 1169 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1169 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1169 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1145 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 1168 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 1171 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 1116 aa  313  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  37.27 
 
 		 1174 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 1168 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  33.52 
 
 		 1147 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 1185 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1170 aa  297  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 1169 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1163 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.48 
 
 		 1184 aa  286  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 733 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1316 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  36.27 
 
 		 676 aa  277  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 733 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 		 733 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 744 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 		 854 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  32.61 
 
 		 842 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 856 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 567 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.65 
 
 		 854 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  38.83 
 
 		 881 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 		 635 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 		 655 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 		 554 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 556 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 		 645 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  37.02 
 
 		 868 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  32.59 
 
 		 747 aa  238  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 634 aa  233  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 758 aa  228  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  37.39 
 
 		 577 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  36.41 
 
 		 487 aa  227  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 816 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  38.3 
 
 		 594 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  35.73 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>