More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3355 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 880 aa  1751    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  63.22 
 
 		 884 aa  995    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.11 
 
 		 884 aa  994    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  67.77 
 
 		 881 aa  1133    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  64.83 
 
 		 883 aa  1040    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  61.74 
 
 		 545 aa  654    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.29 
 
 		 545 aa  664    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  40.79 
 
 		 1148 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  42.53 
 
 		 1141 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 1140 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  40.07 
 
 		 1145 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  40.12 
 
 		 1142 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 		 1146 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 1172 aa  392  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 		 1146 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 1146 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 1146 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 1146 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 		 1159 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  39.53 
 
 		 1146 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  43.94 
 
 		 1159 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 1140 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 1145 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  43.94 
 
 		 1159 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 		 1146 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 1140 aa  379  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  42.53 
 
 		 1157 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  41.32 
 
 		 1150 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  39.17 
 
 		 1177 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  42.1 
 
 		 1161 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 		 1156 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 		 1159 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 1159 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  38.42 
 
 		 1055 aa  366  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 1158 aa  364  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  39.71 
 
 		 1147 aa  364  4e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 1159 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1152 aa  363  6e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 		 1138 aa  363  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.98 
 
 		 1158 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 1175 aa  355  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.08 
 
 		 1179 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 1152 aa  350  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 1172 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 1168 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.96 
 
 		 1156 aa  343  9e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 1111 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1168 aa  334  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1145 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 1166 aa  332  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 1161 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 		 1172 aa  320  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  34.35 
 
 		 1147 aa  319  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  37.69 
 
 		 1169 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 1177 aa  311  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1116 aa  310  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  41.3 
 
 		 1006 aa  309  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  49.42 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  49.42 
 
 		 588 aa  307  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  36.47 
 
 		 1174 aa  306  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.11 
 
 		 1168 aa  304  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 1168 aa  302  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1174 aa  302  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 1171 aa  297  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 1169 aa  297  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 1169 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1185 aa  292  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1169 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.82 
 
 		 1169 aa  290  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1167 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.9 
 
 		 1184 aa  289  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.08 
 
 		 1316 aa  286  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 733 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 733 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  41.94 
 
 		 585 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 1163 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  43.86 
 
 		 585 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1170 aa  281  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 585 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 		 585 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 733 aa  280  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  45.29 
 
 		 585 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1168 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 		 554 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 585 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 567 aa  277  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 		 556 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 635 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1169 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  33.21 
 
 		 842 aa  271  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 645 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  42.47 
 
 		 868 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  42.36 
 
 		 881 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 655 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 586 aa  265  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.51 
 
 		 854 aa  261  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 854 aa  261  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 574 aa  258  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 744 aa  257  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 591 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>