More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72740 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.76 
 
 
585 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  64.41 
 
 
585 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  65.09 
 
 
585 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  67.82 
 
 
586 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  96.82 
 
 
586 aa  1088    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.11 
 
 
585 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  64.46 
 
 
585 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.29 
 
 
585 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  100 
 
 
588 aa  1161    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.59 
 
 
591 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  52.48 
 
 
592 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  39.83 
 
 
616 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  40.07 
 
 
630 aa  351  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  39.68 
 
 
621 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  39.79 
 
 
626 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  39.12 
 
 
621 aa  324  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
628 aa  323  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  38.66 
 
 
626 aa  312  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  36.79 
 
 
623 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.74 
 
 
880 aa  308  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  48.92 
 
 
881 aa  308  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  34.07 
 
 
666 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  38.72 
 
 
600 aa  303  9e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  40.68 
 
 
591 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.9 
 
 
677 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.9 
 
 
677 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  37.42 
 
 
665 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
672 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
669 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
669 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  35.23 
 
 
669 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.75 
 
 
677 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  36.29 
 
 
659 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  36.48 
 
 
670 aa  297  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  34.12 
 
 
666 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  38.73 
 
 
611 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  37.83 
 
 
615 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.9 
 
 
677 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
637 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  35.52 
 
 
667 aa  294  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  37.37 
 
 
597 aa  294  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  35.22 
 
 
600 aa  293  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
627 aa  293  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  37.41 
 
 
638 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
622 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.91 
 
 
884 aa  292  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  36.47 
 
 
600 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  35.67 
 
 
669 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.64 
 
 
884 aa  290  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  35.89 
 
 
668 aa  290  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
631 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
598 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
672 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
618 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
598 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
598 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  32.26 
 
 
598 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  36.44 
 
 
625 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
638 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
634 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
634 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  36.71 
 
 
625 aa  286  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  35.3 
 
 
627 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  37.8 
 
 
623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  37.29 
 
 
622 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
683 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
668 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
621 aa  283  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
652 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
603 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
677 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  37.5 
 
 
630 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
603 aa  281  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  37.19 
 
 
615 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.32 
 
 
883 aa  280  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
635 aa  280  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
603 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
622 aa  277  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  33.09 
 
 
603 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  34.9 
 
 
620 aa  277  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  31.52 
 
 
594 aa  277  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
623 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  34.13 
 
 
604 aa  274  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.43 
 
 
611 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.06 
 
 
643 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
627 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  33.9 
 
 
643 aa  273  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  36.23 
 
 
603 aa  273  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  35.71 
 
 
604 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  34.4 
 
 
643 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
620 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
604 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  36.97 
 
 
590 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  32.72 
 
 
601 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 
598 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  32.73 
 
 
597 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  36.44 
 
 
634 aa  270  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
643 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
606 aa  269  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  36.13 
 
 
612 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>