More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0289 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  97.57 
 
 		 604 aa  1103    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  78.17 
 
 		 602 aa  896    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  77.65 
 
 		 604 aa  856    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  64.92 
 
 		 599 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  81.46 
 
 		 604 aa  922    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  69.87 
 
 		 603 aa  733    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  100 
 
 		 604 aa  1219    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.97 
 
 		 604 aa  799    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  97.75 
 
 		 604 aa  1104    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  94.54 
 
 		 604 aa  1083    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  65.08 
 
 		 612 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 		 622 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 621 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  39.49 
 
 		 616 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  38.1 
 
 		 597 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  37.59 
 
 		 600 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  37.69 
 
 		 626 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 683 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  37.33 
 
 		 623 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 652 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  38.09 
 
 		 670 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  37.89 
 
 		 666 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  37.54 
 
 		 666 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 672 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  37.33 
 
 		 634 aa  327  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  38.68 
 
 		 665 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  37.12 
 
 		 618 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  36.96 
 
 		 633 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  37.34 
 
 		 669 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  38.11 
 
 		 615 aa  323  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  38.93 
 
 		 668 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  38.4 
 
 		 677 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  38.4 
 
 		 677 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 635 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  38.39 
 
 		 669 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 669 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 669 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 672 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 637 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 603 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  36.36 
 
 		 621 aa  317  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.01 
 
 		 677 aa  316  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  36.03 
 
 		 600 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  36.36 
 
 		 626 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 627 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.66 
 
 		 677 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 603 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  35.46 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  36.55 
 
 		 659 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 603 aa  312  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 623 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 628 aa  312  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 677 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  32.74 
 
 		 603 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.3 
 
 		 631 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.57 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  36.73 
 
 		 621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  32.08 
 
 		 598 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 598 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 598 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  33.67 
 
 		 594 aa  307  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 598 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  36.06 
 
 		 627 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  35.82 
 
 		 643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 638 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  37.39 
 
 		 638 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  36.82 
 
 		 622 aa  303  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 635 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  38.19 
 
 		 591 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 643 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  36.11 
 
 		 600 aa  300  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  32.85 
 
 		 643 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 634 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  32.69 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 635 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 634 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 607 aa  296  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.67 
 
 		 597 aa  296  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 634 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 591 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 627 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  32.94 
 
 		 601 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  38.91 
 
 		 590 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  30.51 
 
 		 613 aa  291  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  37.2 
 
 		 625 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  31.51 
 
 		 608 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 668 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  36.7 
 
 		 625 aa  287  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 620 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  36.15 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  35.55 
 
 		 611 aa  282  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  35.84 
 
 		 586 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 618 aa  278  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  35.59 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  36.45 
 
 		 630 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>