More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0589 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  72.74 
 
 		 638 aa  815    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  100 
 
 		 590 aa  1180    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  49.09 
 
 		 616 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  48.77 
 
 		 623 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  48.28 
 
 		 626 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 		 637 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  46.02 
 
 		 618 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  46.41 
 
 		 633 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  46.39 
 
 		 635 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  45.47 
 
 		 643 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 635 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 		 634 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 		 634 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 		 634 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  42.68 
 
 		 626 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  42.68 
 
 		 621 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  41.23 
 
 		 630 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 683 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  41.82 
 
 		 621 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 628 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  41.07 
 
 		 659 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  39.05 
 
 		 666 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  39.36 
 
 		 666 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 672 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  40.35 
 
 		 670 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 668 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  38.98 
 
 		 669 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  40.5 
 
 		 665 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 669 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 669 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  39.61 
 
 		 677 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  39.61 
 
 		 677 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  39.93 
 
 		 677 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  39.64 
 
 		 668 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  39.64 
 
 		 669 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 672 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  40.37 
 
 		 677 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 634 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 634 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 623 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 638 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 631 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 627 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  37.04 
 
 		 627 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 677 aa  347  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  41.75 
 
 		 600 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 591 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  36.38 
 
 		 597 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  39.1 
 
 		 635 aa  332  9e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  37.69 
 
 		 615 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 635 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 627 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  38.77 
 
 		 645 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 652 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  40.3 
 
 		 591 aa  326  8.000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  36.15 
 
 		 600 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  36.35 
 
 		 667 aa  321  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  36.05 
 
 		 622 aa  318  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 606 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  37.84 
 
 		 602 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  35.22 
 
 		 643 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.22 
 
 		 643 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  37.46 
 
 		 634 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  35.74 
 
 		 643 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  36.54 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  34.05 
 
 		 601 aa  306  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  39.05 
 
 		 612 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  31.92 
 
 		 594 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 622 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 585 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  36.74 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  36.82 
 
 		 617 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  35.91 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 585 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  36.88 
 
 		 604 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  38.29 
 
 		 599 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  37.92 
 
 		 604 aa  300  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 585 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  39.11 
 
 		 611 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 622 aa  295  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  37.19 
 
 		 604 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07091  histidine kinase  33.71 
 
 		 637 aa  294  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  35.22 
 
 		 604 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 604 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 621 aa  293  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  36.97 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  37.07 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 624 aa  289  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  36.02 
 
 		 625 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  35.85 
 
 		 625 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  34.86 
 
 		 585 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  37.3 
 
 		 585 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  32.45 
 
 		 597 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 602 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 586 aa  277  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  36.25 
 
 		 615 aa  277  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  32.86 
 
 		 604 aa  276  9e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  36.56 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 618 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>