More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001013 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07091  histidine kinase  75.97 
 
 		 637 aa  984    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 624 aa  1285    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.72 
 
 		 597 aa  293  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  30.44 
 
 		 613 aa  290  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 683 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 603 aa  286  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.97 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  33 
 
 		 600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 598 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  32.26 
 
 		 598 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 598 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 598 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  31.02 
 
 		 669 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  33.67 
 
 		 601 aa  281  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 637 aa  281  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 603 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  32.85 
 
 		 603 aa  280  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  29.83 
 
 		 666 aa  280  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 603 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 672 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 652 aa  277  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  33.57 
 
 		 594 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  29.64 
 
 		 666 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  31.05 
 
 		 669 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 634 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  32.64 
 
 		 626 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  31.72 
 
 		 668 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 607 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  34.02 
 
 		 602 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 659 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  32.11 
 
 		 621 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  34.33 
 
 		 590 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 668 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 634 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 635 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 634 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 622 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  31.14 
 
 		 677 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  30.98 
 
 		 630 aa  261  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  31.14 
 
 		 677 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 677 aa  261  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.27 
 
 		 677 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  29.02 
 
 		 643 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  30.21 
 
 		 608 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 635 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.14 
 
 		 677 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  34.46 
 
 		 604 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  32.71 
 
 		 604 aa  256  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  30.74 
 
 		 665 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  33.33 
 
 		 638 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  29.88 
 
 		 615 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 635 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  28.8 
 
 		 643 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 628 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  28.93 
 
 		 643 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  28.59 
 
 		 643 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 604 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 621 aa  250  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 602 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 638 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  32.71 
 
 		 599 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 631 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  32.71 
 
 		 612 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  30.34 
 
 		 618 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  30.96 
 
 		 604 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  31.53 
 
 		 634 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  29.09 
 
 		 600 aa  247  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 634 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  30.24 
 
 		 633 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 634 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 627 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  28.57 
 
 		 627 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  31.14 
 
 		 604 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 672 aa  244  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 604 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 604 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  31.02 
 
 		 670 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  31.73 
 
 		 623 aa  242  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  30.7 
 
 		 667 aa  242  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  32.58 
 
 		 603 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  31.94 
 
 		 621 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 		 618 aa  240  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  31.1 
 
 		 597 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 622 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 627 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  29.16 
 
 		 604 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 621 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 623 aa  234  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  29.68 
 
 		 625 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  30.66 
 
 		 645 aa  233  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  29.95 
 
 		 625 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  29.84 
 
 		 615 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 591 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  31.27 
 
 		 600 aa  227  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 585 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  29.77 
 
 		 623 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 606 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>