More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0187 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  85.18 
 
 		 665 aa  1055    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.06 
 
 		 683 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  61.09 
 
 		 659 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  54.29 
 
 		 669 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  96.73 
 
 		 670 aa  1267    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  54.25 
 
 		 666 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.8 
 
 		 668 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  54.09 
 
 		 666 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 672 aa  1369    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  55.68 
 
 		 677 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  56.51 
 
 		 668 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  55.11 
 
 		 669 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.89 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 		 672 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.89 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  55.68 
 
 		 677 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  55.84 
 
 		 677 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  56.32 
 
 		 677 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.02 
 
 		 677 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  44.44 
 
 		 616 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  42.37 
 
 		 623 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 628 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  42.49 
 
 		 626 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  42.31 
 
 		 621 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  41.46 
 
 		 626 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 637 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 623 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 627 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  41.13 
 
 		 630 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 634 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 634 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  39.06 
 
 		 627 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 638 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  40.76 
 
 		 633 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  39.87 
 
 		 618 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 631 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  41.42 
 
 		 621 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 635 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  39.31 
 
 		 643 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  39.9 
 
 		 635 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  38.67 
 
 		 597 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 634 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  43.89 
 
 		 638 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 634 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 634 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 627 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  41.45 
 
 		 615 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 635 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  37.44 
 
 		 600 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 652 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  41.96 
 
 		 590 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  41.39 
 
 		 634 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  39.22 
 
 		 645 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  39.93 
 
 		 643 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  38.29 
 
 		 643 aa  351  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  38.54 
 
 		 667 aa  350  7e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  39.77 
 
 		 643 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 621 aa  348  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 622 aa  340  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  34.47 
 
 		 594 aa  339  8e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  37.35 
 
 		 600 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  37.2 
 
 		 635 aa  333  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 604 aa  330  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  40.41 
 
 		 591 aa  329  8e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  37.95 
 
 		 602 aa  329  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  36.89 
 
 		 603 aa  329  9e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  37.54 
 
 		 612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  34.42 
 
 		 600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  39.45 
 
 		 622 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.27 
 
 		 597 aa  326  7e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  37.54 
 
 		 599 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  37.12 
 
 		 585 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  37.78 
 
 		 604 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 606 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 604 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  37.61 
 
 		 604 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  37.09 
 
 		 604 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  37.46 
 
 		 617 aa  319  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  38.13 
 
 		 604 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 618 aa  318  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 604 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  35.12 
 
 		 620 aa  313  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.9 
 
 		 611 aa  312  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 603 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  37.02 
 
 		 586 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  33.98 
 
 		 622 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 603 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  37.44 
 
 		 588 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  30.1 
 
 		 603 aa  310  8e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  34.94 
 
 		 601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  30.27 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 598 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 603 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  35.25 
 
 		 600 aa  307  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  28.64 
 
 		 613 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 607 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 591 aa  301  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>