More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1420 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  68.6 
 
 
630 aa  764    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  97.44 
 
 
626 aa  1150    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  92.75 
 
 
621 aa  1035    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  100 
 
 
621 aa  1211    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  42.78 
 
 
616 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
683 aa  399  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
672 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  42.63 
 
 
623 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  42.68 
 
 
590 aa  392  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  41.94 
 
 
670 aa  389  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
628 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  41.84 
 
 
665 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  41.82 
 
 
659 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  39.76 
 
 
626 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
627 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  39.97 
 
 
677 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  39.97 
 
 
677 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  38.25 
 
 
669 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  41.2 
 
 
638 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
631 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  39.24 
 
 
668 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
668 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
638 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  39.86 
 
 
677 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  39.33 
 
 
677 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
634 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
623 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
634 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  40.53 
 
 
627 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  37.2 
 
 
666 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
669 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
669 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  37.12 
 
 
666 aa  362  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  38.95 
 
 
633 aa  359  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
672 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
627 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  38.6 
 
 
669 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.09 
 
 
677 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  40.54 
 
 
615 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
635 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  39.18 
 
 
586 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  37.67 
 
 
618 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  39.68 
 
 
588 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
637 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
622 aa  342  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
652 aa  337  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  40.36 
 
 
645 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  39.46 
 
 
634 aa  334  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  37.73 
 
 
597 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
634 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  38.5 
 
 
585 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
634 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
635 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  38.4 
 
 
600 aa  330  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
634 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  37.59 
 
 
643 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
606 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  38.38 
 
 
585 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
586 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  37.68 
 
 
600 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  38.71 
 
 
611 aa  325  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
604 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  38.21 
 
 
604 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  36.27 
 
 
635 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  37.37 
 
 
602 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 
591 aa  319  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  40.37 
 
 
591 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  36.99 
 
 
585 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
585 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  36.6 
 
 
667 aa  316  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
585 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
585 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
621 aa  313  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
618 aa  310  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  37.56 
 
 
635 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  40 
 
 
625 aa  306  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  36.36 
 
 
604 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  35.44 
 
 
603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  35.27 
 
 
612 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  38.05 
 
 
604 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.92 
 
 
643 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  35.75 
 
 
643 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  35.75 
 
 
643 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  35.1 
 
 
599 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  38.35 
 
 
615 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  38.5 
 
 
622 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  39.64 
 
 
625 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  35.9 
 
 
604 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  35.73 
 
 
604 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
604 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.73 
 
 
611 aa  294  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  38.58 
 
 
592 aa  293  9e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  36.76 
 
 
617 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  32.06 
 
 
594 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  32.62 
 
 
601 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.33 
 
 
597 aa  287  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
622 aa  286  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  34.2 
 
 
604 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
598 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
598 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>