More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1443 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  60.99 
 
 		 613 aa  741    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 		 598 aa  693    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.31 
 
 		 598 aa  694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  57.48 
 
 		 603 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 607 aa  1253    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  59.36 
 
 		 608 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.12 
 
 		 603 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 		 598 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.65 
 
 		 603 aa  683    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 		 603 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  57.14 
 
 		 598 aa  693    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.28 
 
 		 598 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  52.33 
 
 		 600 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3136.1  two-component sensor histidine kinase  55.56 
 
 		 555 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.01 
 
 		 611 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  38.25 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 652 aa  365  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 683 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 659 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.77 
 
 		 597 aa  318  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  33.55 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  34.6 
 
 		 597 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  29.51 
 
 		 666 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  33.9 
 
 		 600 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  29.73 
 
 		 666 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 621 aa  307  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 672 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  29.57 
 
 		 670 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  29.09 
 
 		 669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07091  histidine kinase  32.22 
 
 		 637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 669 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 669 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 604 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  30.49 
 
 		 668 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 672 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 668 aa  300  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  32.83 
 
 		 604 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 602 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  33.27 
 
 		 630 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 602 aa  296  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  30.38 
 
 		 669 aa  296  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  32.52 
 
 		 604 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  32.33 
 
 		 604 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  31.73 
 
 		 599 aa  293  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 604 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  31.64 
 
 		 604 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 622 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  31.22 
 
 		 612 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 606 aa  286  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  29.04 
 
 		 677 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  29.04 
 
 		 677 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  29.38 
 
 		 665 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 624 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.04 
 
 		 677 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 677 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.31 
 
 		 677 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 591 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 637 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  31.16 
 
 		 603 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  32.5 
 
 		 604 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 591 aa  276  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 628 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 643 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 618 aa  274  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 623 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  29.31 
 
 		 635 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 627 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  29.24 
 
 		 627 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  31.21 
 
 		 617 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  29.17 
 
 		 616 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 638 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  27.81 
 
 		 623 aa  270  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 631 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 634 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 634 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 634 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  30.18 
 
 		 625 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  32.12 
 
 		 618 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  30 
 
 		 625 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 621 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 586 aa  262  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  31.65 
 
 		 622 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  30.31 
 
 		 586 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  28.64 
 
 		 643 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 634 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  28.48 
 
 		 643 aa  260  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  31.53 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  28.07 
 
 		 643 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  31.33 
 
 		 634 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 627 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 634 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 585 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  27.62 
 
 		 667 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 635 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  30.77 
 
 		 615 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 635 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  30.16 
 
 		 588 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 620 aa  256  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  27.83 
 
 		 626 aa  254  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 622 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>