More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2718 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3136.1  two-component sensor histidine kinase  63.28 
 
 		 555 aa  688    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.61 
 
 		 598 aa  811    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.44 
 
 		 598 aa  811    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  60.1 
 
 		 613 aa  735    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  66.11 
 
 		 603 aa  809    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  66.44 
 
 		 598 aa  811    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.44 
 
 		 598 aa  811    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  57 
 
 		 608 aa  673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.61 
 
 		 603 aa  789    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  56.8 
 
 		 600 aa  661    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.44 
 
 		 603 aa  811    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.44 
 
 		 603 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 598 aa  1220    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.44 
 
 		 607 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  40.07 
 
 		 611 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  36.96 
 
 		 594 aa  362  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 		 652 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 683 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  29.56 
 
 		 666 aa  330  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 659 aa  327  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 668 aa  326  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  34.93 
 
 		 601 aa  323  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  36.05 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  30.02 
 
 		 666 aa  321  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  30.18 
 
 		 677 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  30.18 
 
 		 677 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.56 
 
 		 597 aa  317  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 622 aa  317  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  34.39 
 
 		 600 aa  316  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.18 
 
 		 677 aa  316  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  28.41 
 
 		 669 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  30.03 
 
 		 668 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.21 
 
 		 677 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 		 621 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 606 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 672 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  32.84 
 
 		 623 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  32.53 
 
 		 602 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  30.77 
 
 		 616 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  28.81 
 
 		 669 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07091  histidine kinase  32.94 
 
 		 637 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 637 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 672 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 602 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  28.57 
 
 		 670 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  31.67 
 
 		 586 aa  293  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  33.94 
 
 		 617 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 604 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  31.6 
 
 		 604 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  32.15 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  31.08 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 643 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 677 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  28.93 
 
 		 665 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  32.78 
 
 		 635 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 604 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 604 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  32.08 
 
 		 618 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  31.08 
 
 		 612 aa  286  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  31.52 
 
 		 604 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 604 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  31.44 
 
 		 633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  29.96 
 
 		 621 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  29.96 
 
 		 626 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  31.44 
 
 		 615 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 635 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  31.61 
 
 		 643 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 591 aa  283  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 621 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  31.66 
 
 		 615 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 624 aa  281  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  31.61 
 
 		 643 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.21 
 
 		 643 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  31.4 
 
 		 604 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  31.68 
 
 		 600 aa  278  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  33.69 
 
 		 591 aa  277  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  32.18 
 
 		 622 aa  277  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 627 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  30.28 
 
 		 626 aa  276  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  29.1 
 
 		 627 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  31.05 
 
 		 634 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 634 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 634 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 634 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 635 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 623 aa  273  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 627 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 634 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 634 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  32.06 
 
 		 645 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 631 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  29.8 
 
 		 621 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  30.37 
 
 		 603 aa  270  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 585 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  29.98 
 
 		 585 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 585 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 638 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>