More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4291 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.42 
 
 
585 aa  773    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.42 
 
 
585 aa  774    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  100 
 
 
585 aa  1180    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  88.7 
 
 
585 aa  1038    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  73.02 
 
 
586 aa  808    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.24 
 
 
585 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  68.9 
 
 
585 aa  767    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  65.52 
 
 
588 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  65.34 
 
 
586 aa  701    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.72 
 
 
591 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  51.14 
 
 
592 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  39.74 
 
 
621 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  39.56 
 
 
626 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  37.39 
 
 
616 aa  333  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  38.53 
 
 
630 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  35.27 
 
 
623 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  37.02 
 
 
677 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.27 
 
 
677 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.27 
 
 
677 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  36.9 
 
 
626 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  35.04 
 
 
670 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
672 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  35.34 
 
 
627 aa  293  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
634 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
634 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  36.69 
 
 
621 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  36.46 
 
 
659 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.4 
 
 
677 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  33.22 
 
 
666 aa  290  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
628 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
638 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  36.55 
 
 
615 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
631 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  33.39 
 
 
666 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
635 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  36.1 
 
 
665 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
627 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
627 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  35.73 
 
 
597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
669 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
669 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  44.66 
 
 
881 aa  283  8.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  35.25 
 
 
669 aa  283  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  34.55 
 
 
668 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  34.19 
 
 
604 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
637 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  34.9 
 
 
669 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
672 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  35.89 
 
 
600 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
603 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
623 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  31.96 
 
 
594 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
621 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
683 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
603 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  31.51 
 
 
603 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
622 aa  273  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.13 
 
 
884 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  35.99 
 
 
638 aa  273  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  35.3 
 
 
634 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.18 
 
 
880 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
598 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.06 
 
 
643 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.6 
 
 
884 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  32.9 
 
 
643 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
598 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
598 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  35.41 
 
 
618 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  30.96 
 
 
598 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
677 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  35.73 
 
 
617 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  32.9 
 
 
643 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
603 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  34.15 
 
 
643 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  37.37 
 
 
590 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 
622 aa  267  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  36.65 
 
 
591 aa  267  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
652 aa  267  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
668 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.07 
 
 
883 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  35.12 
 
 
633 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  33.28 
 
 
600 aa  263  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  35.82 
 
 
645 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  33.98 
 
 
620 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  34.87 
 
 
615 aa  260  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  34.69 
 
 
600 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  34.64 
 
 
623 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.71 
 
 
611 aa  256  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  33.04 
 
 
625 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  33.05 
 
 
625 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  35.51 
 
 
630 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
604 aa  252  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  33 
 
 
635 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  33.12 
 
 
635 aa  251  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  31.79 
 
 
667 aa  250  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  32.28 
 
 
602 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
621 aa  250  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  33.39 
 
 
603 aa  250  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  34.19 
 
 
611 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>