More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1723 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.14 
 
 		 598 aa  753    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3136.1  two-component sensor histidine kinase  57.95 
 
 		 555 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  100 
 
 		 608 aa  1253    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.14 
 
 		 598 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.14 
 
 		 598 aa  753    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.36 
 
 		 607 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  56.32 
 
 		 600 aa  679    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  60.14 
 
 		 598 aa  753    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.67 
 
 		 603 aa  756    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.5 
 
 		 603 aa  769    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  60.67 
 
 		 603 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57 
 
 		 598 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.81 
 
 		 603 aa  748    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  71.19 
 
 		 613 aa  857    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  39.34 
 
 		 611 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  36.72 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 652 aa  359  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  34.67 
 
 		 601 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.89 
 
 		 597 aa  332  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 622 aa  331  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  35.39 
 
 		 597 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  30.06 
 
 		 666 aa  317  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  30.39 
 
 		 666 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  34.56 
 
 		 600 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  31.22 
 
 		 616 aa  309  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 591 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 659 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  29.06 
 
 		 670 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 621 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.63 
 
 		 677 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  29.46 
 
 		 677 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  29.46 
 
 		 677 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.22 
 
 		 677 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 672 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 683 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 602 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  32.27 
 
 		 623 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  28.22 
 
 		 668 aa  293  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07091  histidine kinase  31.81 
 
 		 637 aa  293  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 668 aa  293  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  27.49 
 
 		 669 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 602 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 672 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  28.21 
 
 		 669 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  31.69 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 669 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 669 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  29.51 
 
 		 665 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  32.76 
 
 		 604 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  30.89 
 
 		 603 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 604 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  31.69 
 
 		 604 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  30.99 
 
 		 612 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  30.99 
 
 		 599 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  31.68 
 
 		 604 aa  279  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 624 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 604 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 628 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 677 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  31.2 
 
 		 615 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 635 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  31.1 
 
 		 622 aa  269  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  28.11 
 
 		 626 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 623 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  28.06 
 
 		 621 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  30.3 
 
 		 634 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  30.07 
 
 		 588 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  32.8 
 
 		 591 aa  267  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 634 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 637 aa  265  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 585 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 586 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  29.69 
 
 		 586 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  30.59 
 
 		 630 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  28.23 
 
 		 626 aa  261  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 585 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 634 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 638 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  28.69 
 
 		 600 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 618 aa  260  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  29.58 
 
 		 625 aa  259  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  27.37 
 
 		 645 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 635 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 622 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 627 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  29.58 
 
 		 625 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 634 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 634 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 631 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  28.52 
 
 		 627 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  29.06 
 
 		 620 aa  256  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  29.48 
 
 		 618 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  27.55 
 
 		 621 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 634 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 585 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 585 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 621 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  28.98 
 
 		 615 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>