More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2911 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3136.1  two-component sensor histidine kinase  60.94 
 
 		 555 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.52 
 
 		 598 aa  775    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  55.48 
 
 		 600 aa  670    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  71.19 
 
 		 608 aa  844    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  63.7 
 
 		 603 aa  775    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.99 
 
 		 607 aa  705    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.52 
 
 		 598 aa  775    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 613 aa  1257    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.69 
 
 		 598 aa  775    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.86 
 
 		 603 aa  767    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.7 
 
 		 603 aa  770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  62.52 
 
 		 598 aa  775    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.53 
 
 		 603 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.1 
 
 		 598 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.21 
 
 		 611 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  36.72 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 652 aa  347  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  34.39 
 
 		 601 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 659 aa  316  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 668 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.22 
 
 		 597 aa  312  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 622 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  29.61 
 
 		 666 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  34.43 
 
 		 597 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  34.67 
 
 		 600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07091  histidine kinase  31.25 
 
 		 637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 672 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  28.41 
 
 		 670 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 624 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  28.68 
 
 		 666 aa  300  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 683 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  27.56 
 
 		 669 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 602 aa  293  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 621 aa  292  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  27.93 
 
 		 677 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  27.88 
 
 		 668 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  27.93 
 
 		 677 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 669 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 669 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 602 aa  287  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  27.93 
 
 		 677 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  29.05 
 
 		 665 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  28.43 
 
 		 677 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 672 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  30.69 
 
 		 604 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  29.81 
 
 		 616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 623 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 606 aa  283  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  27.55 
 
 		 669 aa  282  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 604 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 604 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 627 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  29.93 
 
 		 623 aa  279  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 637 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  30.86 
 
 		 604 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 		 604 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  31.19 
 
 		 599 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 591 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 631 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 677 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 638 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  31.16 
 
 		 604 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  29.26 
 
 		 585 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  30.66 
 
 		 612 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 618 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  28.57 
 
 		 627 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  28.97 
 
 		 621 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 634 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 634 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  31.96 
 
 		 622 aa  270  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 635 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.76 
 
 		 628 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  29.8 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  32 
 
 		 591 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  31.36 
 
 		 618 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  28.8 
 
 		 626 aa  266  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 604 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 634 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 634 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  29.82 
 
 		 603 aa  262  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  30.34 
 
 		 630 aa  262  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  29.57 
 
 		 633 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 621 aa  261  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 586 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  29.12 
 
 		 634 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  30.43 
 
 		 617 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 634 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 635 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 643 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  28.85 
 
 		 620 aa  259  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  27.46 
 
 		 667 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  30.15 
 
 		 635 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  28.43 
 
 		 645 aa  257  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  31.55 
 
 		 623 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 635 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  29.55 
 
 		 588 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  30.63 
 
 		 622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  29.41 
 
 		 600 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  29.2 
 
 		 586 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  29.15 
 
 		 615 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>