More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2927 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.62 
 
 		 677 aa  1234    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.34 
 
 		 683 aa  894    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  78.49 
 
 		 677 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  71.54 
 
 		 666 aa  931    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  94.2 
 
 		 669 aa  1243    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  78.81 
 
 		 677 aa  982    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  79.12 
 
 		 677 aa  984    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  78.81 
 
 		 677 aa  982    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  72.16 
 
 		 666 aa  943    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  94.91 
 
 		 669 aa  1241    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  95.37 
 
 		 669 aa  1213    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 672 aa  1345    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  95.37 
 
 		 669 aa  1213    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  91.4 
 
 		 668 aa  1157    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  55.66 
 
 		 670 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.75 
 
 		 672 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  53.1 
 
 		 659 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  56.59 
 
 		 665 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.94 
 
 		 668 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0202  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  74.84 
 
 		 289 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1391  putative C4-dicarboxylate transport sensor protein  74.84 
 
 		 289 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  42.43 
 
 		 616 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  40.13 
 
 		 623 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  40.53 
 
 		 626 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0203  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  77.25 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1390  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  77.25 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 628 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  42.04 
 
 		 638 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  38.79 
 
 		 630 aa  369  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  38.38 
 
 		 626 aa  359  9e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  37.75 
 
 		 621 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 637 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  37.13 
 
 		 618 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 652 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  39.67 
 
 		 590 aa  340  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 634 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  36.12 
 
 		 633 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  35.95 
 
 		 597 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  38.45 
 
 		 634 aa  336  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  35.4 
 
 		 635 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 635 aa  336  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  38.99 
 
 		 602 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  39.26 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  38.4 
 
 		 622 aa  333  5e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 634 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  39.93 
 
 		 615 aa  333  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 634 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 635 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  36.24 
 
 		 600 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 621 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 598 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 598 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  30.66 
 
 		 598 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 598 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  37.48 
 
 		 620 aa  330  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  37.69 
 
 		 600 aa  330  7e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  32.59 
 
 		 600 aa  330  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.85 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  38.84 
 
 		 603 aa  327  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  38.83 
 
 		 623 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  34.89 
 
 		 643 aa  327  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 622 aa  326  9e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  40.2 
 
 		 591 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 634 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  36.71 
 
 		 627 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 634 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  38.18 
 
 		 622 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 627 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 621 aa  325  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  35.49 
 
 		 643 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  38.42 
 
 		 612 aa  324  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 638 aa  323  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.91 
 
 		 643 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 631 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  35.57 
 
 		 643 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 603 aa  321  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  37.52 
 
 		 645 aa  320  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 623 aa  318  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  38.25 
 
 		 600 aa  318  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 604 aa  318  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  38.24 
 
 		 617 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 627 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  37.89 
 
 		 599 aa  316  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 618 aa  316  9e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  35.39 
 
 		 667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  38.99 
 
 		 604 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  38.18 
 
 		 604 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  38.7 
 
 		 604 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 603 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  30.67 
 
 		 603 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  37.83 
 
 		 604 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 606 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  37.83 
 
 		 604 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  35.86 
 
 		 635 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 604 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  32.08 
 
 		 594 aa  302  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.09 
 
 		 611 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  38.69 
 
 		 625 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 622 aa  297  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>