More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1436 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  100 
 
 		 617 aa  1210    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  56.48 
 
 		 615 aa  554  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  52.56 
 
 		 604 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 621 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  47.33 
 
 		 620 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  46.86 
 
 		 600 aa  455  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  46.42 
 
 		 623 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  46.81 
 
 		 622 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 		 618 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  42.98 
 
 		 625 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  44.27 
 
 		 630 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  43.33 
 
 		 625 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 620 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  38.94 
 
 		 623 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4764  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 560 aa  343  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 683 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  39.55 
 
 		 668 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 672 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  37.98 
 
 		 659 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  36.88 
 
 		 670 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 672 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  37.91 
 
 		 669 aa  333  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 		 669 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 		 669 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  38.46 
 
 		 616 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  38.69 
 
 		 669 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 668 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 677 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  38.11 
 
 		 667 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 623 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  43.16 
 
 		 624 aa  320  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  37.39 
 
 		 665 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  37.57 
 
 		 626 aa  318  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  37.61 
 
 		 621 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 603 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.18 
 
 		 597 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.82 
 
 		 677 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  36.41 
 
 		 627 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  36.82 
 
 		 677 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.98 
 
 		 677 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  38.04 
 
 		 630 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  35.37 
 
 		 666 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  34.63 
 
 		 603 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  38.66 
 
 		 638 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  35.44 
 
 		 666 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 631 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 634 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 634 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  38.49 
 
 		 621 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  34.06 
 
 		 594 aa  304  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 638 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 627 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 637 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  35.36 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.77 
 
 		 677 aa  299  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 627 aa  298  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 592 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 603 aa  296  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  35.91 
 
 		 599 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  35.91 
 
 		 612 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  35.7 
 
 		 633 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 598 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 643 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  36.27 
 
 		 626 aa  292  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  32.69 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  37.22 
 
 		 590 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  34.69 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  34.33 
 
 		 601 aa  290  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 652 aa  287  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  33.83 
 
 		 600 aa  287  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 586 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  35.19 
 
 		 600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  35.07 
 
 		 618 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 635 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  35.65 
 
 		 603 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  35.36 
 
 		 585 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 628 aa  277  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 634 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 585 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  35.46 
 
 		 588 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  37.13 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  35.04 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 634 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  31.17 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  36.14 
 
 		 602 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  34.52 
 
 		 645 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 622 aa  273  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  36.77 
 
 		 615 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 634 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 635 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 607 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  34.74 
 
 		 600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 585 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  36.85 
 
 		 604 aa  270  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>