More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18010 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  100 
 
 
592 aa  1149    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.76 
 
 
591 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  52.18 
 
 
585 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  54.04 
 
 
588 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  52.84 
 
 
586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  51.14 
 
 
585 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.73 
 
 
586 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.87 
 
 
585 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.69 
 
 
585 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.52 
 
 
585 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  50.17 
 
 
585 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  38.15 
 
 
616 aa  332  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  36.1 
 
 
623 aa  317  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  37.13 
 
 
659 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  37.31 
 
 
627 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 
623 aa  306  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
634 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
634 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
631 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
627 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
638 aa  303  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
627 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  39.79 
 
 
621 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  39.4 
 
 
626 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  34.66 
 
 
666 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  36.78 
 
 
626 aa  296  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  31.88 
 
 
594 aa  293  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
652 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  33.76 
 
 
666 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  38.13 
 
 
600 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
668 aa  287  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
683 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.46 
 
 
643 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
637 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  34.3 
 
 
643 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  36.87 
 
 
630 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  35.46 
 
 
633 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  39.22 
 
 
621 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  34.15 
 
 
667 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  34.29 
 
 
643 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  38.36 
 
 
590 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
628 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
622 aa  280  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
672 aa  280  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  35.28 
 
 
618 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  36.84 
 
 
638 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  35.74 
 
 
620 aa  278  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  35.83 
 
 
599 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  34.38 
 
 
669 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  34.73 
 
 
670 aa  276  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  35.14 
 
 
622 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  35.65 
 
 
612 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  33.82 
 
 
677 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  33.82 
 
 
677 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  35.68 
 
 
623 aa  273  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  38.93 
 
 
591 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
621 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.3 
 
 
618 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  37.52 
 
 
611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
669 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
669 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.6 
 
 
677 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  35.81 
 
 
615 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
635 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.66 
 
 
677 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  36.96 
 
 
617 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
604 aa  267  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  33 
 
 
597 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  34.74 
 
 
669 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
672 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  35.71 
 
 
634 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  35.08 
 
 
604 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  34.86 
 
 
604 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  34.4 
 
 
668 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
598 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
603 aa  261  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
598 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  29.93 
 
 
598 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.52 
 
 
611 aa  260  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  34.33 
 
 
602 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
598 aa  260  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  33.18 
 
 
635 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  33.39 
 
 
600 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  33.72 
 
 
622 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  34.88 
 
 
665 aa  258  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
677 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  30.39 
 
 
603 aa  256  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  35.48 
 
 
615 aa  256  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
622 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  33.85 
 
 
604 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
603 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.96 
 
 
597 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
604 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  34.52 
 
 
604 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  34.21 
 
 
600 aa  254  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  34.9 
 
 
603 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  34.46 
 
 
604 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  32.7 
 
 
643 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.39 
 
 
634 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
603 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>