More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1731 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
621 aa  1230    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.94 
 
 
622 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  43.42 
 
 
597 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  43.88 
 
 
600 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
606 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  39.62 
 
 
599 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  38.72 
 
 
594 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  40.76 
 
 
604 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  39.24 
 
 
602 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  38.97 
 
 
612 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  39.79 
 
 
604 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
604 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  39.55 
 
 
604 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
628 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
604 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  39.45 
 
 
604 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
672 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  40.43 
 
 
623 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  37.28 
 
 
670 aa  350  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  39.51 
 
 
604 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  40.25 
 
 
616 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  39.36 
 
 
677 aa  348  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  38.68 
 
 
677 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  38.68 
 
 
677 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  41.31 
 
 
622 aa  346  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
652 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.85 
 
 
677 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  38.82 
 
 
603 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  39.32 
 
 
626 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  38.38 
 
 
669 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  35.96 
 
 
666 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  35.4 
 
 
601 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  38.14 
 
 
665 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  37.87 
 
 
669 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
669 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  38.59 
 
 
668 aa  332  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
669 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
672 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.74 
 
 
597 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  39.47 
 
 
634 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
637 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  35.95 
 
 
666 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  37.14 
 
 
659 aa  324  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  39.02 
 
 
615 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
683 aa  321  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
635 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  37.46 
 
 
630 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  36.57 
 
 
621 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
677 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  36.27 
 
 
626 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
668 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
634 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  36.52 
 
 
643 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
634 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  34.4 
 
 
600 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  32.74 
 
 
598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  38.17 
 
 
591 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
603 aa  306  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  35.48 
 
 
635 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
635 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
607 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  32.41 
 
 
603 aa  303  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
591 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
623 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  31.14 
 
 
608 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  37.11 
 
 
621 aa  299  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
618 aa  297  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
598 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  35.18 
 
 
585 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  29.63 
 
 
613 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
634 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
634 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  32.97 
 
 
611 aa  294  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  34.55 
 
 
643 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.39 
 
 
643 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
631 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  35.05 
 
 
627 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  34.22 
 
 
643 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  35.66 
 
 
638 aa  290  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
627 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
620 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
638 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  36.89 
 
 
588 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  36.28 
 
 
600 aa  286  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  36.01 
 
 
623 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  37.65 
 
 
625 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  37.65 
 
 
625 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  35.27 
 
 
620 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  33.68 
 
 
618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  36.98 
 
 
586 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
621 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  37.44 
 
 
645 aa  283  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  33.96 
 
 
633 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
585 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>