More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3079 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  97.84 
 
 		 567 aa  1080    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  70.94 
 
 		 577 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  72.13 
 
 		 574 aa  761    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 556 aa  1105    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  96.2 
 
 		 554 aa  1061    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  71.17 
 
 		 594 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 		 645 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.56 
 
 		 655 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 		 635 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.14 
 
 		 1156 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.26 
 
 		 1158 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.56 
 
 		 1159 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  38.13 
 
 		 1161 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.63 
 
 		 1159 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  45.28 
 
 		 1159 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  44.92 
 
 		 1159 aa  319  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.85 
 
 		 854 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 		 1159 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  45.15 
 
 		 1157 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 		 1172 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.02 
 
 		 1158 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 		 1140 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  43.06 
 
 		 881 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  42.56 
 
 		 868 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 856 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 1316 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 		 1163 aa  298  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 744 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  41.78 
 
 		 1147 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 1159 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  40.86 
 
 		 1142 aa  294  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 		 1146 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 854 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  40.18 
 
 		 1145 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  43.51 
 
 		 1169 aa  289  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  40.46 
 
 		 1148 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 1146 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  40.27 
 
 		 1146 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 1146 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1146 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 1146 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 1146 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  41.06 
 
 		 1055 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 		 1174 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  40.6 
 
 		 1177 aa  286  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1145 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 		 1167 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 1140 aa  282  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 		 1140 aa  280  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  39.86 
 
 		 1141 aa  280  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  37.44 
 
 		 842 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 		 1138 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 		 1170 aa  277  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  39.81 
 
 		 1174 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 1152 aa  274  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 		 880 aa  273  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.93 
 
 		 1169 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1171 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 1169 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  41.03 
 
 		 1150 aa  266  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 634 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1152 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 883 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1169 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  37.69 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  41.38 
 
 		 881 aa  257  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.29 
 
 		 1179 aa  257  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 		 816 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1168 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  39.38 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 		 1177 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 		 1172 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 1168 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 1175 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 1145 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 1169 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1172 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  37.47 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 1168 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  40.81 
 
 		 454 aa  246  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  38.5 
 
 		 545 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 545 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.4 
 
 		 1184 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  35.24 
 
 		 1147 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 733 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 733 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 1168 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  41.09 
 
 		 447 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  40.86 
 
 		 454 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.67 
 
 		 1168 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 884 aa  240  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  37.1 
 
 		 676 aa  240  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 884 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  39.25 
 
 		 448 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  38.44 
 
 		 441 aa  237  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1169 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 733 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  36.4 
 
 		 747 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 672 aa  231  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  39.39 
 
 		 476 aa  230  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>