More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3756 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 672 aa  1299    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 817 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  42.75 
 
 		 591 aa  279  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 634 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.3 
 
 		 662 aa  278  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 		 675 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  39.56 
 
 		 487 aa  260  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  40.59 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  40.75 
 
 		 868 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 854 aa  257  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 574 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 1172 aa  254  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  39.75 
 
 		 881 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 		 1146 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1140 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 655 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 571 aa  251  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 645 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 		 816 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 554 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  37.66 
 
 		 1145 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  37.41 
 
 		 1146 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 1146 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 1145 aa  249  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  39.9 
 
 		 629 aa  248  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 589 aa  248  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1146 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 635 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1146 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 556 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 1146 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 1146 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 567 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 621 aa  246  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1159 aa  246  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  34.53 
 
 		 1169 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  37.22 
 
 		 1142 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.37 
 
 		 1445 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 655 aa  243  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 662 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  34.22 
 
 		 577 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.16 
 
 		 1169 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 744 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1140 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  37.41 
 
 		 1141 aa  239  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 1174 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1169 aa  237  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.08 
 
 		 854 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 856 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 1111 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  37.12 
 
 		 477 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 657 aa  233  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 		 609 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 477 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 		 1167 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 1172 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  39.95 
 
 		 447 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 610 aa  231  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  34.46 
 
 		 842 aa  229  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1140 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  39.53 
 
 		 606 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  36.61 
 
 		 1174 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 1316 aa  229  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 653 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  40.05 
 
 		 452 aa  227  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 1168 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 		 663 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  35.06 
 
 		 476 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  39.79 
 
 		 633 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1163 aa  225  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 1168 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 1169 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  37.4 
 
 		 1147 aa  223  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 1170 aa  223  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1169 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  33.69 
 
 		 594 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  38.42 
 
 		 881 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 		 1171 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 733 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 733 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 1152 aa  220  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1177 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  35.58 
 
 		 676 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  37.6 
 
 		 448 aa  217  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  35.66 
 
 		 1148 aa  216  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  38.89 
 
 		 454 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  39.15 
 
 		 454 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  39.15 
 
 		 447 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  36.25 
 
 		 1055 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  34.95 
 
 		 666 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  38.36 
 
 		 663 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 1169 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  36.9 
 
 		 747 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  36.32 
 
 		 441 aa  214  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  35.68 
 
 		 1159 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 561 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 733 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  35.43 
 
 		 1159 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 545 aa  211  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>