More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3605 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 610 aa  1193    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  69.3 
 
 		 591 aa  771    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 		 539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4041  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 543 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 		 561 aa  313  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.31 
 
 		 545 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0898  sensor histidine kinase/response regulator  46.65 
 
 		 537 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.535257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.4 
 
 		 540 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.51 
 
 		 548 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  46.4 
 
 		 540 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  43.27 
 
 		 564 aa  299  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0896  sensor histidine kinase/response regulator  43.24 
 
 		 551 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.406466  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 		 1174 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.35 
 
 		 1169 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 1146 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 1146 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1146 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  34.47 
 
 		 1145 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 1168 aa  239  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1167 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4203  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 520 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 1146 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  34.49 
 
 		 1146 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 1146 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 1146 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  36.2 
 
 		 1141 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1172 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  36.3 
 
 		 447 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 1145 aa  233  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 1158 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  36.3 
 
 		 452 aa  230  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1159 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1159 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1171 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1140 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 1159 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  36.99 
 
 		 1159 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  33.84 
 
 		 1142 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  36.2 
 
 		 1157 aa  223  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 662 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1156 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  36.73 
 
 		 1159 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  33.92 
 
 		 1147 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  36.09 
 
 		 1161 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 634 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 1159 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  35.17 
 
 		 1174 aa  219  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1163 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  33.15 
 
 		 609 aa  217  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 		 1172 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  33.42 
 
 		 1148 aa  216  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  39.74 
 
 		 441 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  34.51 
 
 		 868 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1140 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  35.37 
 
 		 881 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  33.77 
 
 		 591 aa  213  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1166 aa  211  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  33.42 
 
 		 1177 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  33.92 
 
 		 1055 aa  210  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 672 aa  210  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1152 aa  209  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  39.57 
 
 		 1150 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  36.18 
 
 		 1169 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 1145 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  38.67 
 
 		 633 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 571 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 816 aa  206  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1169 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 744 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 655 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.59 
 
 		 1158 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 645 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 589 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1169 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1316 aa  204  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1152 aa  203  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1140 aa  203  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 635 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1169 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 655 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  37.01 
 
 		 606 aa  201  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1170 aa  200  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  35.25 
 
 		 577 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  38.55 
 
 		 663 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 1161 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  36.73 
 
 		 747 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 662 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1177 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  32.21 
 
 		 610 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  36.25 
 
 		 594 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 631 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 733 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2698  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 595 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.155122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  37.96 
 
 		 604 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  36.18 
 
 		 629 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 733 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 733 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  39.16 
 
 		 777 aa  194  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 854 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  35.84 
 
 		 758 aa  193  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>