More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3356 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  100 
 
 
633 aa  1228    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 
634 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
675 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
653 aa  270  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 
662 aa  248  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  41.52 
 
 
697 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  33.65 
 
 
663 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1111 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1316 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
1172 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  39.04 
 
 
609 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  32.2 
 
 
629 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  38.55 
 
 
881 aa  216  9e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
655 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  36.98 
 
 
881 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  40.94 
 
 
591 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
645 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
554 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  35.77 
 
 
868 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
556 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
1163 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
635 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
1159 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
1172 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
591 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
1152 aa  208  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1174 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
610 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
1159 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 
672 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
883 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
545 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
567 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 
657 aa  204  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  35.27 
 
 
1159 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  38.65 
 
 
577 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.95 
 
 
854 aa  203  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
1152 aa  203  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
1170 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
1177 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
744 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  35.27 
 
 
1159 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1159 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
854 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.72 
 
 
1156 aa  201  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  37.91 
 
 
545 aa  201  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1167 aa  201  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
1158 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  37.87 
 
 
1169 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
589 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.53 
 
 
1161 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  36.81 
 
 
452 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
1138 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
880 aa  198  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
816 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
663 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  34.3 
 
 
1174 aa  197  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  35.31 
 
 
1147 aa  196  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  46.25 
 
 
606 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1169 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  37.08 
 
 
447 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
561 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 
1157 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  41.16 
 
 
491 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
548 aa  194  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1145 aa  194  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  30.95 
 
 
842 aa  193  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
655 aa  193  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
1161 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  35.95 
 
 
1150 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.58 
 
 
1169 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
662 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1168 aa  193  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  37.89 
 
 
594 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
571 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  33.76 
 
 
1055 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  37.44 
 
 
638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.01 
 
 
1184 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  32.91 
 
 
1177 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  33.16 
 
 
1147 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  36.74 
 
 
610 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
884 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
1168 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
631 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
884 aa  190  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
1169 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
621 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  33.25 
 
 
1148 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.22 
 
 
1158 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
609 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
856 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1156 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  46.58 
 
 
593 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
1169 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2698  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 
595 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.155122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  36.58 
 
 
468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1765  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
586 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316397  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
817 aa  185  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  36.36 
 
 
564 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>