More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2456 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  100 
 
 		 638 aa  1280    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  59.9 
 
 		 611 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  90.64 
 
 		 610 aa  1114    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  61.54 
 
 		 632 aa  717    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  90.39 
 
 		 631 aa  1119    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 594 aa  297  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 625 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 662 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5981  histidine kinase  37.64 
 
 		 619 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 634 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 571 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 675 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 662 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 655 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  33.03 
 
 		 591 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 609 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  38.36 
 
 		 604 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  34.57 
 
 		 606 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 589 aa  197  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 663 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 653 aa  196  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  35.77 
 
 		 1150 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 816 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  32.12 
 
 		 593 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  37.44 
 
 		 633 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  29.05 
 
 		 609 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 1116 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 596 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 733 aa  187  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 733 aa  187  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 1156 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 1147 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 672 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  35.04 
 
 		 577 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 1163 aa  182  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 733 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  35.62 
 
 		 663 aa  181  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1152 aa  180  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 1158 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 1055 aa  179  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.55 
 
 		 1445 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 621 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  32.73 
 
 		 1148 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 1159 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  33.67 
 
 		 1157 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  31.97 
 
 		 1177 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1159 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1172 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  34.01 
 
 		 1159 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 561 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  33.5 
 
 		 758 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 1111 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  34.01 
 
 		 1159 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 567 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 556 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1171 aa  174  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.5 
 
 		 1158 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1159 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 540 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  32.92 
 
 		 1161 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 635 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 574 aa  170  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  32.51 
 
 		 1169 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1172 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 554 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  28.42 
 
 		 1147 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 817 aa  167  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  35.71 
 
 		 594 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  31.39 
 
 		 676 aa  167  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 645 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1145 aa  166  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  30.73 
 
 		 1174 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  34.47 
 
 		 629 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  33.17 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  31.38 
 
 		 747 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0999  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 486 aa  165  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4027  histidine kinase  34.92 
 
 		 471 aa  165  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0361881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 655 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 1152 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 1169 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 1169 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1177 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 744 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 606 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 1168 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  33.42 
 
 		 487 aa  160  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 1316 aa  160  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 883 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  31.07 
 
 		 680 aa  160  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  33.18 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 657 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0472  histidine kinase  34.83 
 
 		 598 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  30.77 
 
 		 881 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 1169 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  29.9 
 
 		 968 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>