More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2881 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  61.54 
 
 		 638 aa  729    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  82.69 
 
 		 611 aa  983    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  61.1 
 
 		 610 aa  719    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  61.1 
 
 		 631 aa  718    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 632 aa  1286    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 625 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5981  histidine kinase  34.61 
 
 		 619 aa  257  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 662 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 634 aa  228  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  38.42 
 
 		 604 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 571 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  31.6 
 
 		 606 aa  212  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  33.92 
 
 		 591 aa  210  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  30.05 
 
 		 609 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 589 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 655 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 675 aa  200  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 663 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 609 aa  197  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  31.26 
 
 		 593 aa  196  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 653 aa  196  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 621 aa  193  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  35.51 
 
 		 1150 aa  191  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 1172 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 596 aa  187  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  33.72 
 
 		 663 aa  187  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 1177 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1152 aa  184  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 610 aa  183  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  34.93 
 
 		 629 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1156 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 816 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  35.28 
 
 		 1157 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  34.1 
 
 		 577 aa  180  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1158 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  30.42 
 
 		 1055 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1163 aa  178  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.71 
 
 		 1445 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 1159 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 1159 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.49 
 
 		 1158 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  30.35 
 
 		 1147 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1159 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 645 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 		 1172 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 672 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  33.33 
 
 		 1161 aa  173  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 1116 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 561 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 733 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 574 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 733 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 		 635 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 733 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4041  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 543 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  32.72 
 
 		 758 aa  170  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 1171 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 545 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0472  histidine kinase  32.01 
 
 		 598 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  32.47 
 
 		 881 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4027  histidine kinase  29.59 
 
 		 471 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0361881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 567 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  29.58 
 
 		 1148 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 556 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  31.52 
 
 		 540 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  32.41 
 
 		 1159 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  32.7 
 
 		 1174 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 655 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  32.41 
 
 		 1159 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 817 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  36.61 
 
 		 777 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1145 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 1111 aa  163  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  32.21 
 
 		 868 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  29.43 
 
 		 1147 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 591 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  33.5 
 
 		 676 aa  160  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  33.17 
 
 		 594 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1177 aa  160  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0898  sensor histidine kinase/response regulator  30.77 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.535257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  33.51 
 
 		 633 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.67 
 
 		 1169 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 554 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 657 aa  156  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  34.06 
 
 		 448 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  29.87 
 
 		 666 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 		 883 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  28.93 
 
 		 968 aa  156  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  30.39 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.61 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 		 1152 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 880 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  30 
 
 		 1141 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 548 aa  154  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 1146 aa  154  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 		 603 aa  154  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  30.13 
 
 		 1142 aa  153  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>