More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0472 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0472  histidine kinase  100 
 
 		 598 aa  1166    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 609 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 		 662 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 662 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 655 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 634 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  36.95 
 
 		 638 aa  183  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 632 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  39.66 
 
 		 663 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  35.44 
 
 		 596 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  32.53 
 
 		 610 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 631 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 880 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 589 aa  171  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 881 aa  170  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.68 
 
 		 611 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 675 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  33.88 
 
 		 606 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  32.24 
 
 		 591 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 		 621 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 657 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1116 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 883 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 1172 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  33.19 
 
 		 910 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1145 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 653 aa  156  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 884 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 884 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 1152 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  32.29 
 
 		 593 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  33.06 
 
 		 633 aa  154  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 554 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  34.22 
 
 		 609 aa  153  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 625 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  29.71 
 
 		 1147 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 556 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  32.66 
 
 		 1153 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  34.29 
 
 		 604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  35.28 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 610 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1169 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  27.98 
 
 		 842 aa  147  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 548 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5981  histidine kinase  35.41 
 
 		 619 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 567 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  33.09 
 
 		 577 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  28.72 
 
 		 543 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 594 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 733 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  31.19 
 
 		 1150 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 733 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 697 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  34.54 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1169 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  31.31 
 
 		 487 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1172 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 		 606 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  29.26 
 
 		 1028 aa  140  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  30.02 
 
 		 1147 aa  140  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 781 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  34.54 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1316 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  31.13 
 
 		 676 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  30.23 
 
 		 656 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 1055 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 		 545 aa  136  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  26.93 
 
 		 724 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 1177 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 1168 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 770 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  35.28 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1163 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 816 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 645 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  26.67 
 
 		 732 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  35.57 
 
 		 2109 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 813 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 1152 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1170 aa  134  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 1165 aa  134  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 733 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  34.67 
 
 		 777 aa  134  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 720 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  29.69 
 
 		 1000 aa  134  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1363 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 561 aa  133  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1138 aa  133  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  27.82 
 
 		 1148 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.75 
 
 		 1445 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  31.27 
 
 		 747 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  31.75 
 
 		 476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.94 
 
 		 1763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  32.13 
 
 		 868 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  34.05 
 
 		 1191 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 		 1786 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 1202 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>