More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2534 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 543 aa  1100    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  55.38 
 
 		 656 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 945 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 785 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1227  ATP-binding region ATPase domain protein  39.68 
 
 		 787 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  39.47 
 
 		 724 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 932 aa  250  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1326 aa  249  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 704 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 1284 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 816 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 662 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  36.3 
 
 		 968 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.21 
 
 		 655 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  35.97 
 
 		 982 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 862 aa  240  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 762 aa  240  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 781 aa  239  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  35.25 
 
 		 1028 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1350 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 827 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 916 aa  238  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1165 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 921 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 898 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  37.94 
 
 		 735 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 631 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1287 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  34.38 
 
 		 764 aa  233  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 830 aa  233  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1029 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.88 
 
 		 1763 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  34.63 
 
 		 1023 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 759 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.94 
 
 		 631 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 1611 aa  231  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 785 aa  230  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  37.44 
 
 		 797 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.92 
 
 		 1560 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1040 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  34.66 
 
 		 578 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1079 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 774 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1003 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 974 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 644 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 653 aa  227  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1768 aa  227  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 1791 aa  226  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  36.78 
 
 		 794 aa  226  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 882 aa  226  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 1548 aa  226  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 863 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1068 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  36 
 
 		 553 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 827 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 881 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.39 
 
 		 763 aa  224  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 570 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 919 aa  223  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30.47 
 
 		 1135 aa  223  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 896 aa  223  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 1127 aa  223  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 		 1255 aa  223  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  34.64 
 
 		 641 aa  223  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  39.1 
 
 		 1574 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  36.08 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 1309 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1002 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 717 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  37.63 
 
 		 1322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.9 
 
 		 882 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 695 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 		 952 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 1075 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 729 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 1131 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 682 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1203 aa  220  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  34.38 
 
 		 588 aa  220  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 1135 aa  220  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 738 aa  220  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4574  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 729 aa  220  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543152  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.1 
 
 		 1060 aa  220  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1765 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 957 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.91 
 
 		 1346 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  32.39 
 
 		 1871 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 1369 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 645 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 1287 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  33.17 
 
 		 1177 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 778 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  33.01 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 1313 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1433 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 995 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 606 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1363 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>