More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2879 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  56.79 
 
 
1001 aa  1019    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  41.21 
 
 
988 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1003 aa  2002    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  40.55 
 
 
952 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.85 
 
 
1032 aa  1014    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  41.11 
 
 
1014 aa  696    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.27 
 
 
1002 aa  1040    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  41.11 
 
 
1032 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.37 
 
 
1002 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1011 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3937  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 
976 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.972695  normal  0.0890412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
1199 aa  304  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1022 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  41.58 
 
 
729 aa  295  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1029 aa  289  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
995 aa  287  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
674 aa  287  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 
1075 aa  286  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
765 aa  286  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
767 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
704 aa  283  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1032 aa  281  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
781 aa  280  8e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
896 aa  279  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
907 aa  279  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1195 aa  277  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
846 aa  277  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
881 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.52 
 
 
882 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
969 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  39.86 
 
 
982 aa  273  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40 
 
 
772 aa  273  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 
1287 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  40.05 
 
 
666 aa  271  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37.96 
 
 
1193 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.89 
 
 
659 aa  270  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
863 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  36.67 
 
 
697 aa  270  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
627 aa  269  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
882 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
877 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  37.78 
 
 
1286 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
785 aa  268  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
1007 aa  268  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 
1039 aa  268  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
1059 aa  268  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
774 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1068 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  38.15 
 
 
736 aa  267  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
902 aa  266  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
1101 aa  266  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
876 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 
973 aa  265  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.31 
 
 
631 aa  265  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3285  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
1034 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
743 aa  264  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.34 
 
 
968 aa  263  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 
524 aa  263  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  40.39 
 
 
1028 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.8 
 
 
763 aa  263  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
982 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 
944 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
764 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
815 aa  261  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
781 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
631 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
633 aa  261  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1132 aa  261  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.26 
 
 
949 aa  260  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  36.26 
 
 
949 aa  260  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.26 
 
 
949 aa  260  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.26 
 
 
949 aa  260  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.26 
 
 
933 aa  260  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 
898 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  36.26 
 
 
933 aa  260  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1452 aa  260  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.26 
 
 
949 aa  260  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.26 
 
 
949 aa  260  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  40.98 
 
 
539 aa  259  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.28 
 
 
951 aa  259  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.32 
 
 
661 aa  259  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
957 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
1049 aa  259  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
643 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 
667 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
959 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
789 aa  259  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  38.62 
 
 
651 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
1116 aa  259  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
1177 aa  259  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
932 aa  258  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
974 aa  258  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
631 aa  258  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.3 
 
 
651 aa  258  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.03 
 
 
949 aa  258  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  39.7 
 
 
853 aa  258  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
827 aa  258  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
910 aa  257  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
1078 aa  257  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
1691 aa  257  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>