More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5151 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  62.55 
 
 
1029 aa  1179    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3285  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.1 
 
 
1034 aa  1108    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  60.95 
 
 
1032 aa  1125    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1022 aa  2035    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 
1002 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  32.43 
 
 
1014 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  32.29 
 
 
988 aa  353  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  32.29 
 
 
1032 aa  353  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  32.77 
 
 
952 aa  345  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3937  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 
976 aa  338  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.972695  normal  0.0890412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1011 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
936 aa  302  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 
1003 aa  300  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
1002 aa  297  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
925 aa  291  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  34.04 
 
 
1122 aa  290  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  29.98 
 
 
1156 aa  290  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.88 
 
 
934 aa  289  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
1001 aa  287  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  33.04 
 
 
935 aa  283  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.18 
 
 
955 aa  277  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  34.53 
 
 
936 aa  274  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.96 
 
 
957 aa  273  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  34.06 
 
 
1053 aa  272  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.11 
 
 
951 aa  271  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  30.25 
 
 
1098 aa  270  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4270  histidine kinase  32.93 
 
 
1175 aa  265  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  32.79 
 
 
1084 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1032 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6941  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
1169 aa  264  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0447401  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.96 
 
 
1129 aa  263  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
1074 aa  263  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  32.02 
 
 
931 aa  260  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
1070 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.86 
 
 
957 aa  258  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.86 
 
 
949 aa  257  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.86 
 
 
949 aa  257  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
1363 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.83 
 
 
1014 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2983  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
1167 aa  252  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
758 aa  252  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.88 
 
 
923 aa  250  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  36.02 
 
 
951 aa  248  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
957 aa  248  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  31.23 
 
 
1082 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
921 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  31.23 
 
 
1082 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4693  histidine kinase  27.01 
 
 
1120 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.027571  hitchhiker  0.0000750184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  35.66 
 
 
951 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
1082 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  32.85 
 
 
1083 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
812 aa  245  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
909 aa  244  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  34.77 
 
 
1177 aa  243  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
1202 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  32.97 
 
 
1322 aa  242  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1485 aa  241  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1316 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.68 
 
 
949 aa  240  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.68 
 
 
949 aa  239  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.68 
 
 
949 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.68 
 
 
933 aa  239  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  34.68 
 
 
949 aa  239  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1550 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.68 
 
 
949 aa  239  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1069 aa  239  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  34.68 
 
 
933 aa  239  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.68 
 
 
949 aa  239  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
1767 aa  239  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.04 
 
 
949 aa  238  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  30.52 
 
 
931 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1767 aa  238  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  30.75 
 
 
1765 aa  237  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.46 
 
 
949 aa  237  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1767 aa  237  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  33.83 
 
 
918 aa  237  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.21 
 
 
1346 aa  237  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.24 
 
 
1763 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
1234 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1771 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.52 
 
 
948 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.86 
 
 
948 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
1768 aa  235  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
914 aa  235  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.52 
 
 
915 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.86 
 
 
948 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  30.53 
 
 
914 aa  234  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  36.86 
 
 
948 aa  235  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  33.14 
 
 
918 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
1238 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  32.85 
 
 
847 aa  233  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
1238 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
1238 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1234 aa  233  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
1238 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  31.82 
 
 
925 aa  232  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1765 aa  232  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
916 aa  231  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  31.93 
 
 
1236 aa  231  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
920 aa  231  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>