More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3285 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.37 
 
 
1029 aa  1097    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  60.02 
 
 
1032 aa  1096    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3285  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1034 aa  2083    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  59.22 
 
 
1022 aa  1118    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  32.13 
 
 
988 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  32.13 
 
 
1014 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  31.99 
 
 
1032 aa  356  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  33 
 
 
952 aa  343  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
1002 aa  324  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3937  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
976 aa  310  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.972695  normal  0.0890412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
1011 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  34.6 
 
 
936 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
925 aa  303  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  29.53 
 
 
1122 aa  287  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  31.08 
 
 
931 aa  281  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4270  histidine kinase  30.38 
 
 
1175 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
1002 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
1001 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.32 
 
 
955 aa  272  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  34.46 
 
 
1053 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 
1003 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  27.73 
 
 
1098 aa  270  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
936 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  32.32 
 
 
1084 aa  267  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.82 
 
 
934 aa  263  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
1074 aa  262  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.66 
 
 
1129 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.9 
 
 
949 aa  259  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.9 
 
 
933 aa  259  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  27.9 
 
 
949 aa  259  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  27.9 
 
 
933 aa  259  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
1070 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.9 
 
 
949 aa  259  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.9 
 
 
949 aa  259  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.9 
 
 
949 aa  258  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.9 
 
 
949 aa  259  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6941  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 
1169 aa  258  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0447401  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.22 
 
 
948 aa  257  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.37 
 
 
948 aa  257  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.22 
 
 
948 aa  257  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.22 
 
 
948 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  28.39 
 
 
1156 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.76 
 
 
949 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.93 
 
 
957 aa  253  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  36.24 
 
 
935 aa  251  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
1032 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4693  histidine kinase  26.82 
 
 
1120 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.027571  hitchhiker  0.0000750184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  29.14 
 
 
1082 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
1082 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  29.14 
 
 
1082 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  32.47 
 
 
1083 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.2 
 
 
1763 aa  241  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.59 
 
 
1014 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
1363 aa  235  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  34.55 
 
 
847 aa  234  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
1550 aa  233  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1767 aa  233  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
1267 aa  232  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
1765 aa  232  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  33.33 
 
 
951 aa  232  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1767 aa  232  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
1310 aa  231  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
957 aa  231  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
1266 aa  231  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
1193 aa  231  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
1582 aa  231  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  33.27 
 
 
785 aa  231  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.39 
 
 
896 aa  229  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  31.09 
 
 
1322 aa  229  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.17 
 
 
1069 aa  229  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  33.46 
 
 
905 aa  228  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
921 aa  227  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1238 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  30.49 
 
 
914 aa  226  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1238 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  34.27 
 
 
918 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1238 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1238 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1485 aa  225  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 
914 aa  225  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
758 aa  225  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  33.99 
 
 
785 aa  225  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1767 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
682 aa  224  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
1234 aa  224  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  33.79 
 
 
785 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1236 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1236 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
1305 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  33.21 
 
 
918 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1236 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1202 aa  222  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
1771 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  30.83 
 
 
1351 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  33.15 
 
 
1177 aa  221  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  34.62 
 
 
1309 aa  221  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  33.58 
 
 
785 aa  221  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.39 
 
 
1442 aa  221  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  32.35 
 
 
925 aa  220  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  33.21 
 
 
925 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>