More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3937 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3937  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 976 aa  1989    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.972695  normal  0.0890412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1011 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 1002 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  31.77 
 
 		 1014 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  31.77 
 
 		 988 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  31.66 
 
 		 1032 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 1001 aa  436  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  31.09 
 
 		 952 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 		 1002 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 1003 aa  416  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 1032 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 1022 aa  353  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 1032 aa  324  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3285  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1034 aa  321  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1029 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  37.61 
 
 		 1286 aa  275  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 896 aa  267  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1049 aa  263  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  30.24 
 
 		 1098 aa  262  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.79 
 
 		 659 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 765 aa  260  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  39.85 
 
 		 935 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.38 
 
 		 982 aa  258  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 936 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1059 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 606 aa  254  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 874 aa  254  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 		 785 aa  252  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 968 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  36.13 
 
 		 1193 aa  252  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  38.03 
 
 		 1028 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  33.4 
 
 		 882 aa  251  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  35.49 
 
 		 1213 aa  250  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 1029 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 827 aa  249  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 631 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 781 aa  248  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  36.3 
 
 		 1209 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 633 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 1070 aa  247  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 572 aa  248  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 863 aa  247  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1070 aa  247  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 1196 aa  247  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  35.5 
 
 		 606 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 864 aa  247  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 850 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  38.04 
 
 		 539 aa  246  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1287 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 862 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1127 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  33.71 
 
 		 741 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.92 
 
 		 951 aa  245  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 774 aa  245  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 907 aa  245  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1068 aa  245  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 882 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  34.98 
 
 		 544 aa  244  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.82 
 
 		 968 aa  244  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 916 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 846 aa  243  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 957 aa  243  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 982 aa  242  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.08 
 
 		 763 aa  242  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 947 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 678 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 995 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 1195 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.6 
 
 		 631 aa  241  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  33.68 
 
 		 758 aa  241  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 932 aa  241  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1075 aa  241  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  36.89 
 
 		 856 aa  240  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 		 1407 aa  240  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  36.76 
 
 		 571 aa  240  9e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 959 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  40.22 
 
 		 1177 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 1120 aa  240  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1313 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  33.71 
 
 		 691 aa  240  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  34.62 
 
 		 782 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  34.65 
 
 		 641 aa  239  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 1177 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 827 aa  239  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 801 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 1548 aa  239  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 764 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 870 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1069 aa  238  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 645 aa  238  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 662 aa  237  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1007 aa  237  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  35.61 
 
 		 1206 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.92 
 
 		 951 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.02 
 
 		 1023 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1201 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 		 947 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 957 aa  236  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 554 aa  236  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>